RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 CEND1Q8N111 149 aa8.85□□□□□ -0.99
TSTA3-208ENST00000528920 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.85□□□□□ -0.99
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM126AQ9H061 195 aa8.85□□□□□ -0.99
TSTA3-208ENST00000528920 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.84□□□□□ -0.99
TSTA3-208ENST00000528920 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 NDUFC2O95298 119 aa8.83□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 NPC2P61916 151 aa8.83□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.83□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.82□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 IFITM1P13164 125 aa8.82□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.82□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 UBE2AP49459 152 aa8.81□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 FXYD2P54710 66 aa8.81□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.81□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.81□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.8□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 PRYO14603 147 aa8.8□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP10-8P60410 259 aa8.8□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 BATFQ16520 125 aa8.8□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.8□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.8□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.79□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 PRLHP81277 87 aa8.79□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 COPS9Q8WXC6 57 aa8.79□□□□□ -1
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.77□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 A6NJY4 79 aa8.77□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 SPRR1AP35321 89 aa8.77□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1B0GWB2 263 aa8.76□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 A4D1N5 150 aa8.76□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 A6NDN8 102 aa8.76□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 IGLV6-57P01721 117 aa8.76□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.76□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.75□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.75□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.75□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 TNXBP22105 4242 aa8.73□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.73□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 CFC1BP0CG36 223 aa8.73□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 CFC1P0CG37 223 aa8.73□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 A0A0B4J2C4 111 aa8.72□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.72□□□□□ -1.01
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.71□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 K7ERJ3 54 aa8.71□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 B5MCH6 92 aa8.7□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 TAX1BP3O14907 124 aa8.7□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.7□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.69□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.69□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 RAB37Q96AX2 223 aa8.68□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.68□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 A0A087X002 238 aa8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 CRYGAP11844 174 aa8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 Q6ZRX8 168 aa8.66□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 C9orf118A6NHY6 69 aa8.65□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 SPRR4Q96PI1 79 aa8.65□□□□□ -1.02
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.64□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 Q9BRP9 147 aa8.64□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 TSPAN13O95857 204 aa8.63□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.63□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 LRP2P98164 4655 aa8.63□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 ERC2-IT1O76042 136 aa8.62□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.62□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 RNF213Q63HN8 5207 aa8.61□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 H3BUT2 72 aa8.6□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 H7C2G1 150 aa8.6□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 C6orf99Q4VX62 202 aa8.59□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TSTA3-208ENST00000528920 COX7BP24311 80 aa8.58□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00483Q53H64 154 aa8.58□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.57□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1B0GV90 55 aa8.57□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1W2PPM0 123 aa8.57□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 Q1RN00 199 aa8.57□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.57□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.56□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.56□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 TRIAP1O43715 76 aa8.55□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 PSMB2P49721 201 aa8.55□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.55□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 FABP2P12104 132 aa8.54□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.53□□□□□ -1.04
TSTA3-208ENST00000528920 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.52□□□□□ -1.05
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.52□□□□□ -1.05
TSTA3-208ENST00000528920 COX6CP09669 75 aa8.51□□□□□ -1.05
TSTA3-208ENST00000528920 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.51□□□□□ -1.05
TSTA3-208ENST00000528920 VAMP3Q15836 100 aa8.51□□□□□ -1.05
TSTA3-208ENST00000528920 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.5□□□□□ -1.05
TSTA3-208ENST00000528920 K7EP34 96 aa8.49□□□□□ -1.05
TSTA3-208ENST00000528920 SPRR1BP22528 89 aa8.49□□□□□ -1.05
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.48□□□□□ -1.05
TSTA3-208ENST00000528920 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.47□□□□□ -1.05
TSTA3-208ENST00000528920 H0YGX0 51 aa8.47□□□□□ -1.05
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