RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514834.1

ITGA3-214, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-214ENST00000514834 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 A4D1N5 150 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 K7ERU9 68 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP10-8P60410 259 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 F8W1H4 67 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 TSPAN13O95857 204 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 CFC1BP0CG36 223 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 CFC1P0CG37 223 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-214ENST00000514834 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 M0QXV9 152 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 IGLV7-43P04211 117 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 REG3GQ6UW15 175 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 LITAFQ99732 161 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 PSMB2P49721 201 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 Q1RN00 199 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 C22orf24Q9Y442 160 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 A0A0U1RRA0 63 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 NDUFC2O95298 119 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 J3QR89 54 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 COX6CP09669 75 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 UBE2BP63146 152 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ITGA3-214ENST00000514834 H3BMG7 143 aa8.4□□□□□ -1.06
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ITGA3-214ENST00000514834 H0Y9J4 135 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 VPREB1P12018 145 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 ATXN8Q156A1 80 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 DAND5Q8N907 189 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 DIRC1Q969H9 104 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 H7C2G1 150 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00167Q96N53 147 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 NPC2P61916 151 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 VPS25Q9BRG1 176 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 TMEM126AQ9H061 195 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.35□□□□□ -1.07
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ITGA3-214ENST00000514834 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 Q8NDZ9 215 aa8.35□□□□□ -1.07
ITGA3-214ENST00000514834 M0R378 163 aa8.34□□□□□ -1.07
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ITGA3-214ENST00000514834 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 TRIAP1O43715 76 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF861PO60384 105 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 BCE1O60756 84 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 ETDBQ3ZM63 59 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 C9JAW5 83 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 SLC25A20O43772 301 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 IGKV2D-28P01615 120 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 TEN1Q86WV5 123 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGA3-214ENST00000514834 H3BT86 120 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGA3-214ENST00000514834 H0YGX0 51 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGA3-214ENST00000514834 LST1O00453 97 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGA3-214ENST00000514834 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.26□□□□□ -1.09
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ITGA3-214ENST00000514834 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.26□□□□□ -1.09
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ITGA3-214ENST00000514834 A0A087X002 238 aa8.23□□□□□ -1.09
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ITGA3-214ENST00000514834 RNF213Q63HN8 5207 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA3-214ENST00000514834 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA3-214ENST00000514834 PRYO14603 147 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA3-214ENST00000514834 TRACP01848 142 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA3-214ENST00000514834 LPAP08519 4548 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA3-214ENST00000514834 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA3-214ENST00000514834 SPRR1AP35321 89 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA3-214ENST00000514834 UBE2AP49459 152 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA3-214ENST00000514834 PRLHP81277 87 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA3-214ENST00000514834 CLEC2BQ92478 149 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA3-214ENST00000514834 A0A1B0GX51 115 aa8.2□□□□□ -1.1
ITGA3-214ENST00000514834 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.2□□□□□ -1.1
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