RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 LINC01549A6NIU2 74 aa0.64□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 SFTA3P0C7M3 94 aa0.64□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.64□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa0.64□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 TENM3Q9P273 2699 aa0.64□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 PIEZO1Q92508 2521 aa0.64□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 MADDQ8WXG6 1647 aa0.64□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.63□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 RALGAPBQ86X10 1494 aa0.63□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 PRO3102Q9H379 93 aa0.63□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 U3KQA8 63 aa0.63□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa0.62□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 DOT1LQ8TEK3 1739 aa0.62□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 LINC00158P58513 81 aa0.62□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 SMIM5Q71RC9 77 aa0.62□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa0.61□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa0.61□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 KCNQ1DNQ9H478 68 aa0.61□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.61□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 NWD1Q149M9 1564 aa0.61□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 MROH1Q8NDA8 1641 aa0.6□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 CRIP1P50238 77 aa0.6□□□□□ -2.31
HERC3-209ENST00000504994 PKDREJQ9NTG1 2253 aa0.58□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 IGF2RP11717 2491 aa0.58□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 ABCA9Q8IUA7 1624 aa0.58□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 PREX1Q8TCU6 1659 aa0.58□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 AKAP6Q13023 2319 aa0.58□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 BCORQ6W2J9 1755 aa0.57□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 USP24Q9UPU5 2620 aa0.57□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 LOC730098B7Z3J9 87 aa0.57□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 TENM4Q6N022 2769 aa0.57□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 RICTORQ6R327 1708 aa0.57□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 TIAM2Q8IVF5 1701 aa0.57□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 CFAP43Q8NDM7 1665 aa0.56□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 FCER1GP30273 86 aa0.56□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 CSMD3Q7Z407 3707 aa0.56□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 DEFB114Q30KQ6 69 aa0.55□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa0.55□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.54□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 H0YAA0 97 aa0.54□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 PHGR1C9JFL3 82 aa0.53□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa0.53□□□□□ -2.32
HERC3-209ENST00000504994 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.53□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 PLCH1Q4KWH8 1693 aa0.53□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 NHSQ6T4R5 1651 aa0.53□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 ITSN1Q15811 1721 aa0.52□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 K7EMI3 77 aa0.52□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 NMES1Q9C002 83 aa0.52□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.52□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 NESP48681 1621 aa0.52□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 VWFP04275 2813 aa0.51□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 LYNX1G3V0Z9 82 aa0.51□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 WIZO95785 1651 aa0.51□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 CHD6Q8TD26 2715 aa0.51□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 ATRQ13535 2644 aa0.5□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 M0R1W7 72 aa0.5□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 DEFB130BP0DP73 79 aa0.5□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 DEFB130AP0DP74 79 aa0.5□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 SERF2P84101 59 aa0.5□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.5□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 NCOR1O75376 2440 aa0.5□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.49□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 IAPPP10997 89 aa0.49□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 ABCC6O95255 1503 aa0.48□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 M0R2T5 61 aa0.48□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa0.48□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.48□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 EEA1Q15075 1411 aa0.47□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 REV3LO60673 3130 aa0.47□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 NRAPQ86VF7 1730 aa0.47□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 DEFB135Q30KP9 77 aa0.47□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 MINOS1Q5TGZ0 78 aa0.47□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 CPS1P31327 1500 aa0.47□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 MUC5ACP98088 5654 aa0.47□□□□□ -2.33
HERC3-209ENST00000504994 TRANK1O15050 2925 aa0.46□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 ABCA6Q8N139 1617 aa0.46□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa0.45□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 TJP1Q07157 1748 aa0.45□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 PRM1P04553 51 aa0.45□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 DEPDC5O75140 1603 aa0.45□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 WNK2Q9Y3S1 2297 aa0.44□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 PRXQ9BXM0 1461 aa0.44□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 H0YGG7 62 aa0.44□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.43□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 IGIPA6NJ69 53 aa0.43□□□□□ -2.34
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