RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	CLIP1	P30622	1438 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	UACA	Q9BZF9	1416 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		0	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		0	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		0	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		0	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		0	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188		M0R2T5	61 aa		0	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	BSN	Q9UPA5	3926 aa		-0	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	USP32	Q8NFA0	1604 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	NWD1	Q149M9	1564 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	MED14	O60244	1454 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	RABAC1	Q9UI14	185 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	ACYP1	P07311	99 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	RICTOR	Q6R327	1708 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	NCOA2	Q15596	1464 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RNF146-208	ENST00000495188	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	ACAN	P16112	2415 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	MYCBP2	O75592	4640 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	NDUFA3	O95167	84 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	DEFB135	Q30KP9	77 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	COL6A3	P12111	3177 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	NBAS	A2RRP1	2371 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	NDUFB1	O75438	58 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	ADIRF	Q15847	76 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	S100A13	Q99584	98 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	ST20	Q9HBF5	79 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	TJP1	Q07157	1748 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	ADAMTS12	P58397	1594 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	ZAN	Q9Y493	2812 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	SPRR2B	P35325	72 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	ERVK-7	P63135	1459 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	KMT2A	Q03164	3969 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	REV3L	O60673	3130 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	ITSN1	Q15811	1721 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	-0.07	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	HSPG2	P98160	4391 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	RNF213	Q63HN8	5207 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188		H3BUT2	72 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	HIVEP1	P15822	2718 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	IFI6	P09912	130 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	RYR2	Q92736	4967 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188		A0A087WXM4	84 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	UMAD1	C9J7I0	102 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	NRAP	Q86VF7	1730 aa		-0.1	□□□□□ -2.42
RNF146-208	ENST00000495188	RYR1	P21817	5038 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	SMIM13	P0DJ93	91 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	-0.1	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	DEFA5	Q01523	94 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	NREP	Q16612	68 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	USH2A	O75445	5202 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	LPA	P08519	4548 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	PLXNC1	O60486	1568 aa		-0.11	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	ABCC1	P33527	1531 aa		-0.11	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	PRO3102	Q9H379	93 aa		-0.11	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	CREBBP	Q92793	2442 aa		-0.11	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		-0.11	□□□□□ -2.43
RNF146-208	ENST00000495188	WIZ	O95785	1651 aa		-0.11	□□□□□ -2.43

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.3 ms