RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 H7C2G1 150 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 K7ERJ3 54 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 BCE1O60756 84 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRR1AP35321 89 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 VAMP3Q15836 100 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf137Q5JT78 98 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 C6orf99Q4VX62 202 aa5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2AP49459 152 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 H0Y9J4 135 aa5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPAN13O95857 204 aa5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV7-43P04211 117 aa5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 COX6CP09669 75 aa5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 COX7BP24311 80 aa5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMB2P49721 201 aa5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4-208ENST00000462602 B5MCH6 92 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 H0YGX0 51 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF861PO60384 105 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZRX8 168 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8N1X5 172 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 Q5VSD8 79 aa5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIAP1O43715 76 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A20O43772 301 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 SNCGO76070 127 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 PRLHP81277 87 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 RYR1P21817 5038 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf118A6NHY6 69 aa5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 TAX1BP3O14907 124 aa5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00575Q6W349 94 aa5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GX51 115 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BUT2 72 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 Q9BRP9 147 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-208ENST00000462602 hADV29S1A0JD25 119 aa5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 HSPG2P98160 4391 aa5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PPM0 123 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 ERC2-IT1O76042 136 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 FABP2P12104 132 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 CLEC2BQ92478 149 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 FAT1Q14517 4588 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAL4O96015 105 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 GHRHP01286 108 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 ATXN8Q156A1 80 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 LST1O00453 97 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 TRACP01848 142 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BQ85 93 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZQY7 126 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRR4Q96PI1 79 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 TCL1BO95988 128 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-208ENST00000462602 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00483Q53H64 154 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRR1BP22528 89 aa5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8N377 158 aa5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 CRYGAP11844 174 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 HERC2O95714 4834 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BMG7 143 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 K7EP34 96 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms