RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 C22orf24Q9Y442 160 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 A4D1N5 150 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 H0Y9J4 135 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 K7EP34 96 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 UBE2BP63146 152 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 CFC1BP0CG36 223 aa8□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 CFC1P0CG37 223 aa8□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 LRP2P98164 4655 aa7.98□□□□□ -1.13
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C9orf3-210ENST00000462125 ERG28Q9UKR5 140 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 TSPAN13O95857 204 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF861PO60384 105 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
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C9orf3-210ENST00000462125 LINC00158P58513 81 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 COX17Q14061 63 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00167Q96N53 147 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 COX6CP09669 75 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 PSMB2P49721 201 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 Q1RN00 199 aa7.93□□□□□ -1.14
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C9orf3-210ENST00000462125 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 BCE1O60756 84 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 DAND5Q8N907 189 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0U1RRA0 63 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 F8W1H4 67 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 PFN2P35080 140 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 NPC2P61916 151 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf3-210ENST00000462125 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFC2O95298 119 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 VPREB1P12018 145 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 ATXN8Q156A1 80 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 H7C2G1 150 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 H3BMG7 143 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 TRIAP1O43715 76 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-210ENST00000462125 TCL1BO95988 128 aa7.83□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 Q8NDZ9 215 aa7.83□□□□□ -1.16
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C9orf3-210ENST00000462125 IGKV2D-28P01615 120 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087X002 238 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 K7ERU9 68 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 UBE2AP49459 152 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM126AQ9H061 195 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 H0YGX0 51 aa7.8□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 J3QR89 54 aa7.8□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 CRYGAP11844 174 aa7.8□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 PRO0461Q9UI25 63 aa7.8□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 LPAP08519 4548 aa7.8□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 M0R378 163 aa7.79□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 LST1O00453 97 aa7.79□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.79□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.79□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.79□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-210ENST00000462125 C9JAW5 83 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 H3BT86 120 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 SLC25A20O43772 301 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 TRACP01848 142 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 PRLHP81277 87 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GX51 115 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 SNCGO76070 127 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 TEN1Q86WV5 123 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 ETDBQ3ZM63 59 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 CLEC2BQ92478 149 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 SPRR1AP35321 89 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 PRR4Q16378 134 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.71□□□□□ -1.18
C9orf3-210ENST00000462125 DNAL4O96015 105 aa7.71□□□□□ -1.18
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