RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.09□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 GAGE10A6NGK3 116 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 A6NJY4 79 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 Q8NDZ9 215 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 NCR3O14931 201 aa7.07□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 IGLV7-43P04211 117 aa7.07□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.06□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 H0Y9J4 135 aa7.06□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 NDUFC2O95298 119 aa7.06□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 VPREB1P12018 145 aa7.06□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.06□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 LINC00167Q96N53 147 aa7.05□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.04□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 K7ERJ3 54 aa7.04□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 IGKV2D-28P01615 120 aa7.04□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 CFC1BP0CG36 223 aa7.04□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 CFC1P0CG37 223 aa7.04□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 PRR4Q16378 134 aa7.04□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 RAB37Q96AX2 223 aa7.04□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.04□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 A0A0B4J2C4 111 aa7.03□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 A6NDN8 102 aa7.03□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.03□□□□□ -1.28
PRAME-210ENST00000442481 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.02□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.02□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.02□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.01□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.01□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 M0R378 163 aa7.01□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 MUC2Q02817 5179 aa7.01□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GWB2 263 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 H7C2G1 150 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 BCE1O60756 84 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 C4orf48Q5BLP8 95 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 PRO1854Q9UHT4 67 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.99□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 UBE2AP49459 152 aa6.99□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 Q1RN00 199 aa6.99□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 ZNF861PO60384 105 aa6.98□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 TMEM126AQ9H061 195 aa6.98□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.97□□□□□ -1.29
PRAME-210ENST00000442481 IGLV6-57P01721 117 aa6.96□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.96□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.96□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.96□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.95□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 TSPAN13O95857 204 aa6.95□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 PRLHP81277 87 aa6.95□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.95□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 TAX1BP3O14907 124 aa6.94□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 PSMB2P49721 201 aa6.94□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 PRYO14603 147 aa6.93□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.93□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.92□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 C6orf99Q4VX62 202 aa6.92□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.92□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 C9orf118A6NHY6 69 aa6.91□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 H3BUT2 72 aa6.91□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 TRIAP1O43715 76 aa6.9□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.9□□□□□ -1.3
PRAME-210ENST00000442481 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.89□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 CRYGAP11844 174 aa6.89□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.89□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.88□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 SPRR1AP35321 89 aa6.88□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.88□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 COX6CP09669 75 aa6.87□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 COX7BP24311 80 aa6.87□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 VAMP3Q15836 100 aa6.87□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.87□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPM0 123 aa6.86□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 A0A087X002 238 aa6.85□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 B5MCH6 92 aa6.85□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.85□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 CLEC2BQ92478 149 aa6.85□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 CDIP1Q9H305 208 aa6.85□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 H0YGX0 51 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 FABP2P12104 132 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZRX8 168 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-210ENST00000442481 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.83□□□□□ -1.32
PRAME-210ENST00000442481 TCL1BO95988 128 aa6.82□□□□□ -1.32
PRAME-210ENST00000442481 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.82□□□□□ -1.32
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A20O43772 301 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-210ENST00000442481 TPRXLQ17RH7 258 aa6.81□□□□□ -1.32
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