RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 ERG28Q9UKR5 140 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 CFC1BP0CG36 223 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 CFC1P0CG37 223 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 PFN2P35080 140 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPC2P61916 151 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 C2orf82Q6UX34 121 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZRP5 223 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 DAND5Q8N907 189 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1W2PNN7 141 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAGE2BQ13066 116 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1W2PPM0 123 aa6.72□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q1RN00 199 aa6.72□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMB2P49721 201 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBE2V1Q13404 147 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 H7C2G1 150 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 TSPAN13O95857 204 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 COX6CP09669 75 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM168BA1KXE4 195 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 K7EP34 96 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP10-8P60410 259 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAGE2EQ4V326 116 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDUFC2O95298 119 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 LPAP08519 4548 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0U1RQV1 116 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRYO14603 147 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATXN8Q156A1 80 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 M0QXV9 152 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 F8W1H4 67 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM126AQ9H061 195 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 H3BMG7 143 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 TCL1BO95988 128 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKV2D-28P01615 120 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 C22orf24Q9Y442 160 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 H0YGX0 51 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNCGO76070 127 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1orf137Q5JT78 98 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCR3O14931 201 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV7-43P04211 117 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 DIRC1Q969H9 104 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 M0R378 163 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBE2BP63146 152 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRR4Q16378 134 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 LST1O00453 97 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q8NDZ9 215 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00167Q96N53 147 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 C9JAW5 83 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRACP01848 142 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 VPREB1P12018 145 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLEC2BQ92478 149 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC25A20O43772 301 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAL4O96015 105 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 H0Y9J4 135 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV6-57P01721 117 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1B0GX51 115 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRO0461Q9UI25 63 aa6.5□□□□□ -1.37
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