RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 C16orf90A8MZG2 172 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 TRIOO75962 3097 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 A8MWP4 228 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 SPEGQ15772 3267 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 EPM2AB3EWF7 344 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 A8MUN3 132 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 Q96NJ1 140 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 RTL8CO15255 209 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 A0A096LNT2 108 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 COA5Q86WW8 74 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-202ENST00000400053 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 J3QL48 77 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 MAST4O15021 2626 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 K7EQZ3 153 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 KLKP1Q107X0 134 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 H7BZZ5 65 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV6-57P01721 117 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF575Q86XF7 245 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 APLNQ9ULZ1 77 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP54Q96N23 3096 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 AKAP13Q12802 2813 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 CD164Q04900 197 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 LUZP6Q538Z0 58 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 LAMA1P25391 3075 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF292O60281 2723 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-202ENST00000400053 PRR15Q8IV56 129 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 MGAQ8IWI9 3026 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 Q8NAQ8 132 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 CENPEQ02224 2701 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 FAM168BA1KXE4 195 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 LCA10Q71F78 164 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 CHTF8P0CG12 524 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GVX0 72 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0G2JQZ4 141 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PNN7 141 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01554Q52M75 96 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF861PO60384 105 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 Q8N377 158 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-202ENST00000400053 MUC3AQ02505 3323 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 IGFL1Q6UW32 110 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 DSCR10P59022 87 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 FRYLO94915 3013 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 FAM104AQ969W3 186 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 ITPR3Q14573 2671 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 PRR34Q9NV39 138 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 CHD6Q8TD26 2715 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 C15orf56Q8N910 161 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PNM2 257 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00483Q53H64 154 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP10-3P60369 221 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-202ENST00000400053 Q1T7F1 81 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-202ENST00000400053 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-202ENST00000400053 COL6A3P12111 3177 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-202ENST00000400053 DMDP11532 3685 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-202ENST00000400053 CR1P17927 2039 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-202ENST00000400053 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV7-43P04211 117 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms