RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384545.1

RNU6-441P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 441, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-441P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-441P-201ENST00000384545 UMAD1C9J7I0 102 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 M0R2T5 61 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 CFAP74Q9C0B2 1584 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 LPAP08519 4548 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 TIAM2Q8IVF5 1701 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 A0A087WXM4 84 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 KMT2AQ03164 3969 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 FAT2Q9NYQ8 4349 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 NWD1Q149M9 1564 aa0.15□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa0.15□□□□□ -2.38
RNU6-441P-201ENST00000384545 IFI6P09912 130 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 CCDC88BA6NC98 1476 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 DOT1LQ8TEK3 1739 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 COL7A1Q02388 2944 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 KMT2DO14686 5537 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 FLNCQ14315 2725 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 NDUFA3O95167 84 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 SMIM13P0DJ93 91 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 SPTA1P02549 2419 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 NREPQ16612 68 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 C18orf32Q8TCD1 76 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 NESP48681 1621 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 CSPG4Q6UVK1 2322 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 ANKARQ7Z5J8 1434 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 DEFB135Q30KP9 77 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 ALMS1Q8TCU4 4167 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 PTPN23Q9H3S7 1636 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-441P-201ENST00000384545 LCE6AA0A183 80 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 MAP3K1Q13233 1512 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 HSPG2P98160 4391 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 CFAP43Q8NDM7 1665 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 ABCA8O94911 1581 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 NDUFA4O00483 81 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 C4AP0C0L4 1744 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 C4BP0C0L5 1744 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 PRO3102Q9H379 93 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 BSNQ9UPA5 3926 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 SPRR2BP35325 72 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 C3orf79P0CE67 100 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-441P-201ENST00000384545 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 CD163L1Q9NR16 1453 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 ADAMTS12P58397 1594 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 PLCH1Q4KWH8 1693 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 SCN11AQ9UI33 1791 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 LINC00158P58513 81 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 PLXNC1O60486 1568 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 RICTORQ6R327 1708 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 WIZO95785 1651 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 H0YGG7 62 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 REV3LO60673 3130 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 HFM1A2PYH4 1435 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 H3BVH4 76 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 LRP2P98164 4655 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 DEFA5Q01523 94 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 DEPDC5O75140 1603 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-441P-201ENST00000384545 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 H0YAA0 97 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 APC2O95996 2303 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 TRANK1O15050 2925 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 ACANP16112 2415 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 AKAP13Q12802 2813 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 LYNX1G3V0Z9 82 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-441P-201ENST00000384545 PDCD5O14737 125 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms