RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.39□□□□□ -1.23
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SPC25-201ENST00000282074 SLC25A20O43772 301 aa7.37□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 Q6ZUT4 128 aa7.37□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.37□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.36□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 TMEM101Q96IK0 257 aa7.36□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 CARD19Q96LW7 228 aa7.36□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.36□□□□□ -1.23
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SPC25-201ENST00000282074 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.35□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.35□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.34□□□□□ -1.23
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SPC25-201ENST00000282074 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.33□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 CDIP1Q9H305 208 aa7.33□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 TRIAP1O43715 76 aa7.33□□□□□ -1.24
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SPC25-201ENST00000282074 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.33□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 C9JAW5 83 aa7.32□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 Q6Q795 121 aa7.32□□□□□ -1.24
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SPC25-201ENST00000282074 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.3□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.3□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 DIRC1Q969H9 104 aa7.3□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.29□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 COX7A2LO14548 114 aa7.29□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 SYCNQ0VAF6 134 aa7.29□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 C1orf137Q5JT78 98 aa7.29□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.28□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.28□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 GAGE2BQ13066 116 aa7.28□□□□□ -1.24
SPC25-201ENST00000282074 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.28□□□□□ -1.24
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SPC25-201ENST00000282074 A0A087WZ39 114 aa7.27□□□□□ -1.25
SPC25-201ENST00000282074 XCL1P47992 114 aa7.27□□□□□ -1.25
SPC25-201ENST00000282074 C2orf82Q6UX34 121 aa7.27□□□□□ -1.25
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PNN7 141 aa7.26□□□□□ -1.25
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SPC25-201ENST00000282074 H7C2G1 150 aa7.24□□□□□ -1.25
SPC25-201ENST00000282074 IGLV7-43P04211 117 aa7.24□□□□□ -1.25
SPC25-201ENST00000282074 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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SPC25-201ENST00000282074 CXCL5P42830 114 aa7.23□□□□□ -1.25
SPC25-201ENST00000282074 A0A1B0GX51 115 aa7.22□□□□□ -1.25
SPC25-201ENST00000282074 SNCGO76070 127 aa7.22□□□□□ -1.25
SPC25-201ENST00000282074 COX17Q14061 63 aa7.22□□□□□ -1.25
SPC25-201ENST00000282074 SS18Q15532 418 aa7.22□□□□□ -1.25
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SPC25-201ENST00000282074 DAND5Q8N907 189 aa7.21□□□□□ -1.25
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SPC25-201ENST00000282074 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SPC25-201ENST00000282074 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.2□□□□□ -1.26
SPC25-201ENST00000282074 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.2□□□□□ -1.26
SPC25-201ENST00000282074 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.19□□□□□ -1.26
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SPC25-201ENST00000282074 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.18□□□□□ -1.26
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SPC25-201ENST00000282074 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.17□□□□□ -1.26
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SPC25-201ENST00000282074 H3BQ85 93 aa7.15□□□□□ -1.26
SPC25-201ENST00000282074 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.15□□□□□ -1.26
SPC25-201ENST00000282074 LINC00643Q86TS7 51 aa7.15□□□□□ -1.26
SPC25-201ENST00000282074 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.14□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 IGKV2D-28P01615 120 aa7.14□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 LINC00158P58513 81 aa7.14□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 NPC2P61916 151 aa7.14□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.14□□□□□ -1.27
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