RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 COX11Q9Y6N1 276 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa15.64■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 A6NJY4 79 aa15.64■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 F8WDY8 70 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 FXYD2P54710 66 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP161Q6P656 301 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 COPS9Q8WXC6 57 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 CKS1BP61024 79 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GWB2 263 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL24P83731 157 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 SPAG11BQ08648 103 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 COX17Q14061 63 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 MEIG1Q5JSS6 88 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 MUSTN1Q8IVN3 82 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-216ENST00000628306 OXTP01178 125 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM13P0DJ93 91 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf48Q96LS8 159 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ERG28Q9UKR5 140 aa15.55■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 TAX1BP3O14907 124 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf82Q6UX34 121 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 C15orf56Q8N910 161 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa15.52■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa15.51■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa15.5■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 A4D1N5 150 aa15.5■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00158P58513 81 aa15.5■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL17AQ8IVW1 177 aa15.5■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.49■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0B4J2C4 111 aa15.49■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 CFC1BP0CG36 223 aa15.49■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 CFC1P0CG37 223 aa15.49■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa15.49■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa15.48■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf118A6NHY6 69 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 DAND5Q8N907 189 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-216ENST00000628306 TNXBP22105 4242 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0U1RRA0 63 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF151Q2KHN1 245 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 PFN2P35080 140 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf25Q5T742 122 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMK2N2Q96S95 79 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 PRO1854Q9UHT4 67 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 LRP2P98164 4655 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L23D6RBM5 183 aa15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GV90 55 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 K7ERJ3 54 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf48Q9UBA6 75 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 MT1HL1P0DM35 61 aa15.4■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB37Q96AX2 223 aa15.4■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00526Q96FQ7 95 aa15.4■□□□□ 0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SYCNQ0VAF6 134 aa15.39■□□□□ 0.05
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF213Q63HN8 5207 aa15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZRU5 148 aa15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFC2O95298 119 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-216ENST00000628306 NPC2P61916 151 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-216ENST00000628306 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-216ENST00000628306 C14orf177Q52M58 125 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BUT2 72 aa15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-216ENST00000628306 TLX1NBP0CAT3 122 aa15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PPM0 123 aa15.32■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa15.32■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PANO1I0J062 215 aa15.32■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN13O95857 204 aa15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CARD19Q96LW7 228 aa15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SLPIP03973 132 aa15.29■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 FABP2P12104 132 aa15.29■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CNBPP62633 177 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa15.27■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV2D-28P01615 120 aa15.27■□□□□ 0.04
CAPNS1-216ENST00000628306 VAMP3Q15836 100 aa15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-216ENST00000628306 LYRM7Q5U5X0 104 aa15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf163Q8N9P6 203 aa15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SDIM1Q6ZPB5 146 aa15.24■□□□□ 0.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2V1Q13404 147 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00337Q8N6G1 96 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-216ENST00000628306 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZRP5 223 aa15.21■□□□□ 0.02
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE10A6NGK3 116 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-216ENST00000628306 K7EP34 96 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa15.19■□□□□ 0.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PKIGQ9Y2B9 76 aa15.19■□□□□ 0.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SPCS1Q9Y6A9 102 aa15.19■□□□□ 0.02
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