RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 ITPR3Q14573 2671 aa9.83□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 LINC00208Q96KT6 92 aa9.82□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 V9GYY9 64 aa9.82□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 LY6G6DO95868 133 aa9.82□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 A6NED7 52 aa9.82□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 C1orf137Q5JT78 98 aa9.82□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 BRI3O95415 125 aa9.81□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 C1orf195Q5TG92 126 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 PSPHP1O15172 72 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 FHL3Q13643 280 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 M0R2N4 97 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 Q6ZTC4 211 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 MUC7Q8TAX7 377 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.77□□□□□ -0.84
RPS6KC1-208ENST00000614059 NOTCH1P46531 2555 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 A0A1B0GUV1 79 aa9.74□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRYO14603 147 aa9.74□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 A0A087WSZ3 146 aa9.73□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.73□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 C14orf177Q52M58 125 aa9.73□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 Q6ZRU5 148 aa9.73□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 CASC2Q6XLA1 102 aa9.72□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.71□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 C10orf25Q5T742 122 aa9.71□□□□□ -0.85
RPS6KC1-208ENST00000614059 C4orf26Q17RF5 130 aa9.71□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 PMAIP1Q13794 54 aa9.71□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 LITAFQ99732 161 aa9.71□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 DMDP11532 3685 aa9.7□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.7□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 CRYGAP11844 174 aa9.69□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 PCOTHQ58A44 107 aa9.69□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.69□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.68□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.68□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.67□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.67□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.67□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 SEC61GP60059 68 aa9.66□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRR15LQ9BU68 103 aa9.66□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRLHP81277 87 aa9.66□□□□□ -0.86
RPS6KC1-208ENST00000614059 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.64□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 TACC2O95359 2948 aa9.64□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 KALRNO60229 2985 aa9.63□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.63□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 KIAA0087Q14695 138 aa9.63□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 ESRGQ1W209 222 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 MUC3AQ02505 3323 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 REG3GQ6UW15 175 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 STAB1Q9NY15 2570 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 SMIM29Q86T20 159 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF292O60281 2723 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 Q9BRP9 147 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 COL6A5A8TX70 2615 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS6KC1-208ENST00000614059 CXCL6P80162 114 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 C7orf33Q8WU49 177 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 H0Y9P7 68 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.56□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 Q6ZQT0 140 aa9.56□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.56□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 C22orf24Q9Y442 160 aa9.56□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.55□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.55□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 C2orf48Q96LS8 159 aa9.55□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 HCG22E2RYF7 251 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRO0628Q9UI54 55 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 RPS28P62857 69 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 X6R8D5 127 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS6KC1-208ENST00000614059 LINC00167Q96N53 147 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS6KC1-208ENST00000614059 C16orf95Q9H693 158 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms