RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 PFN2P35080 140 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 NPC2P61916 151 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 LPAP08519 4548 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.86□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.86□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 LINC00477Q96M19 166 aa7.86□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.85□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.85□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 RNF182Q8N6D2 247 aa7.85□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 ESRGQ1W209 222 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 CLEC2BQ92478 149 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 TIRAPP58753 221 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 SEC61GP60059 68 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 DSCR8Q96T75 97 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 V9GYY9 64 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 USP17L23D6RBM5 183 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 FAM236CP0DP71 79 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 LYRM9A8MSI8 78 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 PRAC2D3DTV9 90 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 MGPP08493 103 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 C20orf173Q96LM9 149 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 U3KQE9 123 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 SCXQ7RTU7 201 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 DNAL4O96015 105 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 PRSS2P07478 247 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 C22orf24Q9Y442 160 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-241ENST00000602290 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 NDUFA1O15239 70 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 NDUFC1O43677 76 aa7.77□□□□□ -1.17
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HCG18-241ENST00000602290 DEFB130AP0DP74 79 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.76□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.76□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.76□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 TMEM243Q9BU79 118 aa7.76□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.75□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 C1orf195Q5TG92 126 aa7.75□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 A0A0J9YXV3 536 aa7.74□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 FHL2Q14192 279 aa7.74□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 H0YGX0 51 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 KLKP1Q107X0 134 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 Q8N814 137 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 H3BNG1 76 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 PRM2P04554 102 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 XCL1P47992 114 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 DEFB1P60022 68 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 PRR9Q5T870 116 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-241ENST00000602290 IGKV3-20P01619 116 aa7.71□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 H7BZZ5 65 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 M0QY20 66 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 SOCS3O14543 225 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 GHRHP01286 108 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 A0A096LPF7 62 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 A0A0U1RQV1 116 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.69□□□□□ -1.18
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