RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580997.1

SENP3-204, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene SENP3, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-204ENST00000580997 COX17Q14061 63 aa7.37□□□□□ -1.23
SENP3-204ENST00000580997 HBDP02042 147 aa7.36□□□□□ -1.23
SENP3-204ENST00000580997 PFN2P35080 140 aa7.36□□□□□ -1.23
SENP3-204ENST00000580997 NDUFA6P56556 154 aa7.36□□□□□ -1.23
SENP3-204ENST00000580997 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.36□□□□□ -1.23
SENP3-204ENST00000580997 CRYGAP11844 174 aa7.35□□□□□ -1.23
SENP3-204ENST00000580997 PMCHL1Q16048 86 aa7.35□□□□□ -1.23
SENP3-204ENST00000580997 ERG28Q9UKR5 140 aa7.35□□□□□ -1.23
SENP3-204ENST00000580997 SFTA2Q6UW10 78 aa7.34□□□□□ -1.23
SENP3-204ENST00000580997 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.34□□□□□ -1.23
SENP3-204ENST00000580997 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.33□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 C11orf86A6NJI1 115 aa7.33□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 IGKV2D-28P01615 120 aa7.33□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 VPREB1P12018 145 aa7.33□□□□□ -1.24
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SENP3-204ENST00000580997 BAGE3Q86Y29 109 aa7.33□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 SCO1O75880 301 aa7.32□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 APOC3P02656 99 aa7.32□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 UBE2AP49459 152 aa7.32□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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SENP3-204ENST00000580997 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.32□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 YPEL4Q96NS1 127 aa7.32□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 SNAPINO95295 136 aa7.31□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.31□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.31□□□□□ -1.24
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SENP3-204ENST00000580997 Q8NDZ9 215 aa7.3□□□□□ -1.24
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SENP3-204ENST00000580997 TMEM126AQ9H061 195 aa7.3□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.29□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 M0R378 163 aa7.29□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 NDUFA5Q16718 116 aa7.29□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 TMEM223A0PJW6 202 aa7.28□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 TMEM238C9JI98 176 aa7.28□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 PRLHP81277 87 aa7.28□□□□□ -1.24
SENP3-204ENST00000580997 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.27□□□□□ -1.25
SENP3-204ENST00000580997 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.27□□□□□ -1.25
SENP3-204ENST00000580997 LINC00158P58513 81 aa7.26□□□□□ -1.25
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SENP3-204ENST00000580997 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.26□□□□□ -1.25
SENP3-204ENST00000580997 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.24□□□□□ -1.25
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SENP3-204ENST00000580997 A0A0U1RRA0 63 aa7.22□□□□□ -1.25
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SENP3-204ENST00000580997 HERV-K104P63124 156 aa7.22□□□□□ -1.25
SENP3-204ENST00000580997 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.21□□□□□ -1.26
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SENP3-204ENST00000580997 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.18□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.18□□□□□ -1.26
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SENP3-204ENST00000580997 PRYO14603 147 aa7.18□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 TRGC2P03986 189 aa7.18□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.18□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.18□□□□□ -1.26
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SENP3-204ENST00000580997 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.18□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.18□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 LINC00310P59036 64 aa7.17□□□□□ -1.26
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SENP3-204ENST00000580997 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.16□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.16□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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SENP3-204ENST00000580997 NCR3O14931 201 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 LEPROTO15243 131 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 SERF1AO75920 110 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 PLNP26678 52 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP3-204ENST00000580997 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.14□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.14□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 H0Y8G0 127 aa7.14□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.14□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.13□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 A0A0U1RQV1 116 aa7.13□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.13□□□□□ -1.27
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SENP3-204ENST00000580997 J3QQQ9 107 aa7.12□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 NMUP48645 174 aa7.12□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 LINC00483Q53H64 154 aa7.12□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.11□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 COLCA2A8K830 154 aa7.11□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 B5MCH6 92 aa7.11□□□□□ -1.27
SENP3-204ENST00000580997 DPM2O94777 84 aa7.11□□□□□ -1.27
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