RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 SFTA2Q6UW10 78 aa3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 PRR34Q9NV39 138 aa3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.61□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 H3BMG7 143 aa3.61□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 TCL1BO95988 128 aa3.61□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 WFDC2Q14508 124 aa3.61□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.61□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.61□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.61□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 Q8IZM0 81 aa3.61□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRDN-205ENST00000546248 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRDN-205ENST00000546248 F8W1H4 67 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRDN-205ENST00000546248 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.6□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRDN-205ENST00000546248 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.6□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRDN-205ENST00000546248 C2orf82Q6UX34 121 aa3.59□□□□□ -1.83
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TRDN-205ENST00000546248 IGKV2D-28P01615 120 aa3.58□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 PFN2P35080 140 aa3.58□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
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TRDN-205ENST00000546248 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.57□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
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TRDN-205ENST00000546248 Q1RN00 199 aa3.56□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 ETDBQ3ZM63 59 aa3.56□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 LINC01620Q4KN68 170 aa3.56□□□□□ -1.84
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TRDN-205ENST00000546248 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.56□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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TRDN-205ENST00000546248 K7ERU9 68 aa3.54□□□□□ -1.84
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TRDN-205ENST00000546248 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 Q8N377 158 aa3.54□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 C15orf56Q8N910 161 aa3.54□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.54□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.54□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.53□□□□□ -1.84
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