RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 LCE3AQ5TA76 89 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 TMEM101Q96IK0 257 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 LYSTQ99698 3801 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 UPK3BQ9BT76 320 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 GTSF1LQ9H1H1 148 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 JPT2Q9H910 190 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 RYR2Q92736 4967 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 A0A0B4J2C4 111 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 TMEM223A0PJW6 202 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 TSPAN13O95857 204 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 IGHV3-30P01768 117 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 CRYGDP07320 174 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 IFITM1P13164 125 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 UBE2D1P51668 147 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 LINC00315P59091 139 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 SFTA2Q6UW10 78 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 NACAE9PAV3 2078 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 A0A0J9YXV3 536 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 TEN1Q86WV5 123 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 C6orf223Q8N319 242 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 OCR1Q9BZK8 76 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 MUC4Q99102 2169 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 A0A0J9YXY3 114 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 C9JAW5 83 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 M0QXV9 152 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 SLC25A20O43772 301 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 TIMM17BO60830 172 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 SNCGO76070 127 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 SPINK8P0C7L1 97 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 UBE2D3P61077 147 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 UBE2D2P62837 147 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 HERVK_113P63121 156 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 LELP1Q5T871 98 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 Q6ZR54 194 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 AMELXQ99217 191 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RBM39-240ENST00000495293 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 PSCAO43653 123 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 TCL1BO95988 128 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 CKS1BP61024 79 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 MIAQ16674 131 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 C2orf82Q6UX34 121 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 SPANXCQ9NY87 97 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 NDUFA1O15239 70 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 RTL8CO15255 209 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 IGHV3-33P01772 117 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 UBE2WQ96B02 151 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 RMI2Q96E14 147 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 TMEM243Q9BU79 118 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 PRO0461Q9UI25 63 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 H3BT86 120 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 CRPP02741 224 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-240ENST00000495293 REG3GQ6UW15 175 aa3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms