RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 LST1O00453 97 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-207ENST00000484547 SPXQ9BT56 116 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A0J9YXV3 536 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-207ENST00000484547 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-207ENST00000484547 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.79□□□□□ -1.16
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RABGEF1-207ENST00000484547 FAM104AQ969W3 186 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6ZSA8 131 aa7.78□□□□□ -1.16
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RABGEF1-207ENST00000484547 GAGE4Q13068 117 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-207ENST00000484547 Q1RN00 199 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.77□□□□□ -1.17
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RABGEF1-207ENST00000484547 H7C423 109 aa7.76□□□□□ -1.17
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RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.76□□□□□ -1.17
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RABGEF1-207ENST00000484547 TRACP01848 142 aa7.73□□□□□ -1.17
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RABGEF1-207ENST00000484547 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-207ENST00000484547 HERV-K104P63124 156 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-207ENST00000484547 RS1O15537 224 aa7.71□□□□□ -1.17
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RABGEF1-207ENST00000484547 PRSS2P07478 247 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.66□□□□□ -1.18
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RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.64□□□□□ -1.19
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RABGEF1-207ENST00000484547 Q9UF83 564 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-207ENST00000484547 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-207ENST00000484547 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-207ENST00000484547 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
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RABGEF1-207ENST00000484547 UQCRQO14949 82 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-207ENST00000484547 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.6□□□□□ -1.19
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RABGEF1-207ENST00000484547 RNF213Q63HN8 5207 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-207ENST00000484547 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.59□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 COX6A2Q02221 97 aa7.59□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.59□□□□□ -1.2
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RABGEF1-207ENST00000484547 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.59□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 TNXBP22105 4242 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1B0GX51 115 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 C14orf177Q52M58 125 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 MT1HL1P0DM35 61 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.57□□□□□ -1.2
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