RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 CDIP1Q9H305 208 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 LAMA3Q16787 3333 aa11.91□□□□□ -0.5
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SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0U1RQV1 116 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 F8WDY8 70 aa11.9□□□□□ -0.5
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SH3BP4-202ENST00000392011 C22orf24Q9Y442 160 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 KLK9Q2XQG4 91 aa11.89□□□□□ -0.51
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SH3BP4-202ENST00000392011 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.87□□□□□ -0.51
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SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0C4DFX4 3053 aa11.84□□□□□ -0.51
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SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.82□□□□□ -0.52
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SH3BP4-202ENST00000392011 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ITPR3Q14573 2671 aa11.81□□□□□ -0.52
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SH3BP4-202ENST00000392011 A6NED7 52 aa11.8□□□□□ -0.52
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SH3BP4-202ENST00000392011 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.78□□□□□ -0.52
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SH3BP4-202ENST00000392011 H3BNG1 76 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP4-202ENST00000392011 PRR15LQ9BU68 103 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-202ENST00000392011 SERP1Q9Y6X1 66 aa11.73□□□□□ -0.53
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SH3BP4-202ENST00000392011 HCG22E2RYF7 251 aa11.71□□□□□ -0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 CXCL6P80162 114 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 H0Y9P7 68 aa11.7□□□□□ -0.54
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SH3BP4-202ENST00000392011 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 K7ERS5 55 aa11.68□□□□□ -0.54
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SH3BP4-202ENST00000392011 A0A096LNT2 108 aa11.68□□□□□ -0.54
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SH3BP4-202ENST00000392011 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.67□□□□□ -0.54
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SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZRX8 168 aa11.62□□□□□ -0.55
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SH3BP4-202ENST00000392011 TRANK1O15050 2925 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZQT0 140 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.62□□□□□ -0.55
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SH3BP4-202ENST00000392011 PSPHP1O15172 72 aa11.61□□□□□ -0.55
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SH3BP4-202ENST00000392011 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 UNC80Q8N2C7 3258 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 CHTF8P0CG12 524 aa11.58□□□□□ -0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 SPINK1P00995 79 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 CHD6Q8TD26 2715 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIOO75962 3097 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 Q8NBF4 154 aa11.57□□□□□ -0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF292O60281 2723 aa11.57□□□□□ -0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 VPREB1P12018 145 aa11.56□□□□□ -0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 EPM2AB3EWF7 344 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 C16orf90A8MZG2 172 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 hDV103S1A0JD37 113 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM168BA1KXE4 195 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV6-57P01721 117 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 CRYGAP11844 174 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.52□□□□□ -0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP10-3P60369 221 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV2-30P06310 120 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf195Q5TG92 126 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP4-202ENST00000392011 LIMD2Q9BT23 127 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-202ENST00000392011 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-202ENST00000392011 RTL8CO15255 209 aa11.49□□□□□ -0.57
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