RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	CKS1B	P61024	79 aa		3.16	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01545	Q5VT33	79 aa		3.16	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZQT7	251 aa		3.16	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		3.16	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01546	A6NGU7	62 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BVH4	76 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	GNRH2	O43555	120 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	INSL3	P51460	131 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB1	P60022	68 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR9	Q5T870	116 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8N8P6	123 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	DCANP1	Q8TF63	244 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	TOMM6	Q96B49	74 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		3.15	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		3.15	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616		A6NED7	52 aa		3.15	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R17	O96001	155 aa		3.15	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	FXYD7	P58549	80 aa		3.15	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		3.15	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMG4	Q5JS54	123 aa		3.15	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		3.15	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	CARD19	Q96LW7	228 aa		3.15	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		3.15	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		3.15	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		3.14	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		3.14	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		3.14	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0J9YX75	114 aa		3.14	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZR54	194 aa		3.14	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	ODF3	Q96PU9	254 aa		3.14	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	C20orf78	Q9BR46	151 aa		3.14	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		3.14	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	C7orf71	A4D174	169 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616		A8MUU9	505 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BMM0	161 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616		K7EMI3	77 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	LECT2	O14960	151 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	COX8A	P10176	69 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	AMTN	Q6UX39	209 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2W	Q96B02	151 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	AP1S3	Q96PC3	154 aa		3.13	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	NOTCH1	P46531	2555 aa		3.12	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	MGP	P08493	103 aa		3.12	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB136	Q30KP8	78 aa		3.12	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	UPK3B	Q9BT76	320 aa		3.12	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		3.12	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	IMUP	Q9GZP8	106 aa		3.12	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616		J3KT08	172 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV1-51	P01701	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB131A	P59861	70 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	SORL1	Q92673	2214 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GW54	56 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GX51	115 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01549	A6NIU2	74 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	DLEU1	O43261	78 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A20	O43772	301 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	DPM2	O94777	84 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKC	P01834	107 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00315	P59091	139 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	LCA10	Q71F78	164 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		3.1	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616		K7EP13	123 aa		3.1	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	PRM2	P04554	102 aa		3.1	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-DRB4	P13762	266 aa		3.1	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	HTN1	P15515	57 aa		3.1	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	PLN	P26678	52 aa		3.1	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM126A	Q9H061	195 aa		3.1	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		3.1	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		3.1	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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