RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 TOMM6Q96B49 74 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 CLLU1Q5K131 121 aa10.98□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 F8VRH5 84 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 ADCYAP1P18509 176 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 CXCL5P42830 114 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 KIAA1644Q3SXP7 199 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 LINC00469Q8N7U9 141 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 C22orf24Q9Y442 160 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-206ENST00000588345 LPAP08519 4548 aa10.96□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 NUPR1O60356 82 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 ZNF861PO60384 105 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 ERASQ7Z444 233 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 XAGE1AQ9HD64 81 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 LINC01546A6NGU7 62 aa10.94□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 TP73-AS1Q9UF72 201 aa10.94□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa10.93□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 SMIM1B2RUZ4 78 aa10.93□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 UQCC3Q6UW78 93 aa10.93□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 SCGB3A1Q96QR1 104 aa10.93□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 LINC01549A6NIU2 74 aa10.92□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 PDZD11Q5EBL8 140 aa10.92□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa10.91□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 TMEM218A2RU14 115 aa10.91□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 GNB1LQ9BYB4 327 aa10.9□□□□□ -0.66
CTIF-206ENST00000588345 COX7B2Q8TF08 81 aa10.89□□□□□ -0.67
CTIF-206ENST00000588345 SEC11CQ9BY50 192 aa10.87□□□□□ -0.67
CTIF-206ENST00000588345 CST9LQ9H4G1 147 aa10.87□□□□□ -0.67
CTIF-206ENST00000588345 BCE1O60756 84 aa10.86□□□□□ -0.67
CTIF-206ENST00000588345 S100PP25815 95 aa10.86□□□□□ -0.67
CTIF-206ENST00000588345 COX19Q49B96 90 aa10.86□□□□□ -0.67
CTIF-206ENST00000588345 RPL28P46779 137 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CTIF-206ENST00000588345 PMVKQ15126 192 aa10.85□□□□□ -0.67
CTIF-206ENST00000588345 LINC00167Q96N53 147 aa10.85□□□□□ -0.67
CTIF-206ENST00000588345 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.84□□□□□ -0.67
CTIF-206ENST00000588345 SPINK8P0C7L1 97 aa10.84□□□□□ -0.67
CTIF-206ENST00000588345 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 FA2HQ7L5A8 372 aa10.82□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 A0A087X002 238 aa10.8□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.8□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 RAB5BP61020 215 aa10.8□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 SMCO4Q9NRQ5 59 aa10.8□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 H3BRM9 83 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 IGLC3P0DOY3 106 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 PRR4Q16378 134 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 C10orf91Q5T1B1 145 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 A0A096LNJ9 63 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 GAGE10A6NGK3 116 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 ATP5LO75964 103 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-206ENST00000588345 CRYGAP11844 174 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 NKAPP1Q8N9T2 125 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 RHEBQ15382 184 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.75□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa10.75□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 COMMD7Q86VX2 200 aa10.74□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 RPS10P5Q9NQ39 176 aa10.74□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 TSPAN13O95857 204 aa10.73□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 PFN2P35080 140 aa10.73□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 UBE2AP49459 152 aa10.73□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 C18orf32Q8TCD1 76 aa10.73□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 VPREB1P12018 145 aa10.72□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 ERG28Q9UKR5 140 aa10.72□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 SCO1O75880 301 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 IGKV2D-28P01615 120 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 HBDP02042 147 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 LINC00614P0C842 121 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 NDUFA6P56556 154 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 COX17Q14061 63 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-206ENST00000588345 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa10.7□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 C11orf86A6NJI1 115 aa10.68□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 RPL24P83731 157 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 SFTA2Q6UW10 78 aa10.68□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 PMCHL1Q16048 86 aa10.67□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 TMEM126AQ9H061 195 aa10.67□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 PRLHP81277 87 aa10.66□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 BAGE3Q86Y29 109 aa10.66□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 Q8NDZ9 215 aa10.66□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 MUC2Q02817 5179 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 M0R378 163 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTIF-206ENST00000588345 TMEM238C9JI98 176 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-206ENST00000588345 NDUFA5Q16718 116 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-206ENST00000588345 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms