RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 RETNQ9HD89 108 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 LYRM9A8MSI8 78 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 PRSS2P07478 247 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 FOXI1Q12951 378 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZUT4 128 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 APOC4P55056 127 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 ETDBQ3ZM63 59 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 LITAFQ99732 161 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A20O43772 301 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 WFDC2Q14508 124 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GUV1 79 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 TCL1BO95988 128 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 GHRHP01286 108 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 ACYP1P07311 99 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 LINC00694P0DN24 101 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 CXCL5P42830 114 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZSN1 163 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZTI0 123 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 FAM104AQ969W3 186 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.64□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 SPINK8P0C7L1 97 aa5.64□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.64□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 LINC01620Q4KN68 170 aa5.64□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 Q9H8V8 135 aa5.64□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 PRO0255Q9UI72 69 aa5.64□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.63□□□□□ -1.51
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GGA3-218ENST00000584243 GAGE12JA6NER3 117 aa5.63□□□□□ -1.51
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GGA3-218ENST00000584243 C16orf90A8MZG2 172 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 LST1O00453 97 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 TRACP01848 142 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 GAGE4Q13068 117 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 GAGE5Q13069 117 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.63□□□□□ -1.51
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GGA3-218ENST00000584243 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 C9JAW5 83 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 SNCGO76070 127 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 GAGE7O76087 117 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 GAGE12FP0CL80 117 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 GAGE12GP0CL81 117 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 GAGE12IP0CL82 117 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 SS18Q15532 418 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 COX7B2Q8TF08 81 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 A8MZ25 164 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 F5H768 121 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 H0YGX0 51 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 COX7A2LO14548 114 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 TRIAP1O43715 76 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 CRPP02741 224 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 MIFP14174 115 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 COX17Q14061 63 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 FHL2Q14192 279 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 UBE2WQ96B02 151 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.61□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GX51 115 aa5.6□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 C2orf82Q6UX34 121 aa5.6□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.6□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 Q8IZM0 81 aa5.6□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.59□□□□□ -1.51
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