RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 Q9H8V8 135 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-215ENST00000583289 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-215ENST00000583289 WNK1Q9H4A3 2382 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-215ENST00000583289 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-215ENST00000583289 ITPR3Q14573 2671 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-215ENST00000583289 APCP25054 2843 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 A0A087WZ39 114 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 H7C2G1 150 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 TRACP01848 142 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 PRM2P04554 102 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 GAGE6Q13070 117 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 C2orf82Q6UX34 121 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 COX7B2Q8TF08 81 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 EPG5Q9HCE0 2579 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 HIVEP2P31629 2446 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1B0GV72 72 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1B0GVY2 172 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 LST1O00453 97 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 COX7A2LO14548 114 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 LY6G6DO95868 133 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 DEFB130BP0DP73 79 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 DEFB130AP0DP74 79 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 MIFP14174 115 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 CXCL5P42830 114 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 COX6A2Q02221 97 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 COX17Q14061 63 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 Q9UF83 564 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 COL12A1Q99715 3063 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 RELNP78509 3460 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 CHD6Q8TD26 2715 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 H3BQ85 93 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 ATP5G1P05496 136 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 Q6Q795 121 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.09□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 Q75L30 129 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 C5orf38Q86SI9 138 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRM-215ENST00000583289 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.09□□□□□ -1.91
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PTPRM-215ENST00000583289 PDZD2O15018 2839 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRM-215ENST00000583289 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.08□□□□□ -1.92
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