RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580022.5

TSPOAP1-AS1-205, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,337 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CCDC179H3BU77 68 aa16.81■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 F5H768 121 aa16.81■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MIFP14174 115 aa16.8■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 COX7A2LO14548 114 aa16.79■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SHISA2Q6UWI4 295 aa16.78■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PRIMA1Q86XR5 153 aa16.78■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MEIG1Q5JSS6 88 aa16.77■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KRTAP10-11P60412 298 aa16.76■□□□□ 0.27
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C3orf56Q8N813 242 aa16.76■□□□□ 0.27
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 COPS9Q8WXC6 57 aa16.75■□□□□ 0.27
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ATP5G1P05496 136 aa16.74■□□□□ 0.27
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SPART-AS1P0CW21 52 aa16.73■□□□□ 0.27
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 HTN3P15516 51 aa16.73■□□□□ 0.27
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 STAB1Q9NY15 2570 aa16.71■□□□□ 0.27
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa16.7■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CLPSL2Q6UWE3 100 aa16.69■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa16.69■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 HERV-K104P63124 156 aa16.69■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SVIPQ8NHG7 77 aa16.69■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TOMM7Q9P0U1 55 aa16.69■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RETNQ9HD89 108 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TRACP01848 142 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FAM218AQ96MZ4 157 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CMYA5Q8N3K9 4069 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 A0A1B0GUV1 79 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ACYP1P07311 99 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C5orf38Q86SI9 138 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 COX7B2Q8TF08 81 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CYSRT1A8MQ03 144 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 BAALC-AS2P0C853 105 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C22orf24Q9Y442 160 aa16.65■□□□□ 0.26
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 XCL1P47992 114 aa16.64■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SMCR5Q8TEV8 140 aa16.64■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ANK2Q01484 3957 aa16.64■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 Q8N3U1 123 aa16.64■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa16.63■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 A0A087WZ39 114 aa16.63■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MAST4O15021 2626 aa16.62■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SS18Q15532 418 aa16.61■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LINC00269Q8N2A0 174 aa16.61■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PPDPFQ9H3Y8 114 aa16.61■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 Q9HAA7 133 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa16.58■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RPL28P46779 137 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LINC00337Q8N6G1 96 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 IMUPQ9GZP8 106 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa16.57■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa16.57■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ANGP03950 147 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 BAHCC1Q9P281 2608 aa16.57■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa16.57■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 IGKV2D-28P01615 120 aa16.57■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CRPP02741 224 aa16.57■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LINC00643Q86TS7 51 aa16.57■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa16.55■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SDIM1Q6ZPB5 146 aa16.54■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa16.54■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MALP21145 153 aa16.53■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 REG3AQ06141 175 aa16.53■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LELP1Q5T871 98 aa16.52■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LINC00158P58513 81 aa16.52■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 INAFM2P0DMQ5 153 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C6orf226Q5I0X4 101 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GAGE2AQ6NT46 116 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SMIM11BQ8TCY0 68 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 A0A087WYN8 130 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 Q6ZTC4 211 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CCL18P55774 89 aa16.48■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PFN2P35080 140 aa16.48■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CD164L2Q6UWJ8 174 aa16.47■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DNAH3Q8TD57 4116 aa16.47■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 COL6A5A8TX70 2615 aa16.47■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LYPD5Q6UWN5 251 aa16.46■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SMIM20Q8N5G0 67 aa16.46■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DNAL4O96015 105 aa16.45■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 Q8IZM0 81 aa16.45■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 A0A0J9YWU9 116 aa16.45■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa16.45■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TENM3Q9P273 2699 aa16.44■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KLK12Q9UKR0 248 aa16.43■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LINC01561Q8N1V8 128 aa16.42■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NOTCH1P46531 2555 aa16.41■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CXCL5P42830 114 aa16.41■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 H0YGX0 51 aa16.41■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C14orf132Q9NPU4 83 aa16.4■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KIAA0087Q14695 138 aa16.38■□□□□ 0.21
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TMEM126AQ9H061 195 aa16.38■□□□□ 0.21
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 H3BNG1 76 aa16.37■□□□□ 0.21
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LECT2O14960 151 aa16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 187.7 ms