RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa16.78■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAGE6Q13070 117 aa16.78■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV2D-28P01615 120 aa16.67■□□□□ 0.26
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa16.65■□□□□ 0.26
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACYP1P07311 99 aa16.65■□□□□ 0.26
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRPP02741 224 aa16.63■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa16.63■□□□□ 0.25
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMCR5Q8TEV8 140 aa16.61■□□□□ 0.25
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOTCH1P46531 2555 aa16.48■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SS18Q15532 418 aa16.47■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H0YGX0 51 aa16.47■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00269Q8N2A0 174 aa16.47■□□□□ 0.23
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C6orf226Q5I0X4 101 aa16.45■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAGE2AQ6NT46 116 aa16.44■□□□□ 0.22
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa16.43■□□□□ 0.22
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LECT2O14960 151 aa16.41■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa16.39■□□□□ 0.22
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR13C6PQ8NH95 151 aa16.39■□□□□ 0.22
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LYPD5Q6UWN5 251 aa16.37■□□□□ 0.21
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C14orf132Q9NPU4 83 aa16.37■□□□□ 0.21
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa16.35■□□□□ 0.21
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD164L2Q6UWJ8 174 aa16.34■□□□□ 0.21
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLPIP03973 132 aa16.33■□□□□ 0.2
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