RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	CYB5A	P00167	134 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	SPRR1B	P22528	89 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	GNG2	P59768	71 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	PLGLA	Q15195	96 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	CUL7	Q14999	1698 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	PSME4	Q14997	1843 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	SBF2	Q86WG5	1849 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	TET3	O43151	1660 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	CCL22	O00626	93 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ACYP1	P07311	99 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	IGLC3	P0DOY3	106 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	NMS	Q5H8A3	153 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	C20orf78	Q9BR46	151 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	HIGD1B	Q9P298	99 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	SPTA1	P02549	2419 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ATP10B	O94823	1461 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	PLXNB2	O15031	1838 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125		A0A1B0GUT8	65 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125		K7EP34	96 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	IGLC2	P0DOY2	106 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00643	Q86TS7	51 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	CLIP1	P30622	1438 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	TCHH	Q07283	1943 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	APC2	O95996	2303 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	FANCA	O15360	1455 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	NLRP1	Q9C000	1473 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	CUX1	P39880	1505 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	NDUFB1	O75438	58 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125		A0A0G2JMZ2	1700 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	NCOR1	O75376	2440 aa		0.09	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	PAPPA	Q13219	1627 aa		0.09	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	SHROOM2	Q13796	1616 aa		0.09	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	COL4A6	Q14031	1691 aa		0.09	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	GAFA1	Q96PS6	74 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	S100A13	Q99584	98 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	APLN	Q9ULZ1	77 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	LAMC1	P11047	1609 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	TOP2B	Q02880	1626 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF292	O60281	2723 aa		0.08	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	SAMD9	Q5K651	1589 aa		0.08	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	UACA	Q9BZF9	1416 aa		0.08	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		0.08	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	COX7B	P24311	80 aa		0.08	□□□□□ -2.4
MDM2-231	ENST00000544125	ADIRF	Q15847	76 aa		0.08	□□□□□ -2.4

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