RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524318.3

SFTPC-211, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

TSL 3

Gene SFTPC, Length 993 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-211ENST00000524318 TOMM6Q96B49 74 aa6.3□□□□□ -1.4
SFTPC-211ENST00000524318 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SFTPC-211ENST00000524318 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.3□□□□□ -1.4
SFTPC-211ENST00000524318 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.29□□□□□ -1.4
SFTPC-211ENST00000524318 TIMM17AQ99595 171 aa6.29□□□□□ -1.4
SFTPC-211ENST00000524318 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.29□□□□□ -1.4
SFTPC-211ENST00000524318 C22orf24Q9Y442 160 aa6.29□□□□□ -1.4
SFTPC-211ENST00000524318 F8VRH5 84 aa6.28□□□□□ -1.4
SFTPC-211ENST00000524318 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SFTPC-211ENST00000524318 ERASQ7Z444 233 aa6.28□□□□□ -1.4
SFTPC-211ENST00000524318 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.28□□□□□ -1.4
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF861PO60384 105 aa6.27□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 CLLU1Q5K131 121 aa6.27□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 NUPR1O60356 82 aa6.26□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 ADCYAP1P18509 176 aa6.26□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 CXCL5P42830 114 aa6.26□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.25□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.25□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM218A2RU14 115 aa6.25□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.25□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.25□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 COX7B2Q8TF08 81 aa6.25□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.25□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 LINC01546A6NGU7 62 aa6.24□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 LINC01549A6NIU2 74 aa6.24□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 S100PP25815 95 aa6.24□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 UQCC3Q6UW78 93 aa6.24□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.24□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 CST9LQ9H4G1 147 aa6.24□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.23□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 LINC00167Q96N53 147 aa6.23□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 LPAP08519 4548 aa6.22□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.22□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 BCE1O60756 84 aa6.22□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 SPINK8P0C7L1 97 aa6.22□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 RAB5BP61020 215 aa6.22□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 PRR4Q16378 134 aa6.22□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 FA2HQ7L5A8 372 aa6.22□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 SEC11CQ9BY50 192 aa6.22□□□□□ -1.41
SFTPC-211ENST00000524318 GAGE10A6NGK3 116 aa6.21□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.21□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 PMVKQ15126 192 aa6.21□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 COX19Q49B96 90 aa6.21□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 IFITM2Q01629 132 aa6.2□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.2□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.19□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 H3BRM9 83 aa6.19□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 ATP5LO75964 103 aa6.19□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 TSPAN13O95857 204 aa6.19□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 A0A087X002 238 aa6.18□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 CRYGAP11844 174 aa6.18□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 NDUFA6P56556 154 aa6.18□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.18□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 PFN2P35080 140 aa6.17□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 UBE2AP49459 152 aa6.17□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.17□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.17□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.17□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.16□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 SCO1O75880 301 aa6.16□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 LINC00614P0C842 121 aa6.16□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 IGLC3P0DOY3 106 aa6.16□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 COMMD7Q86VX2 200 aa6.16□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.15□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 A0A096LNJ9 63 aa6.15□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 IGKV2D-28P01615 120 aa6.15□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 RHEBQ15382 184 aa6.15□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.15□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.15□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.15□□□□□ -1.42
SFTPC-211ENST00000524318 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.14□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.14□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.14□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 ERG28Q9UKR5 140 aa6.14□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 HBDP02042 147 aa6.13□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 VPREB1P12018 145 aa6.13□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 COX17Q14061 63 aa6.13□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 PMCHL1Q16048 86 aa6.13□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.13□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 C11orf86A6NJI1 115 aa6.12□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 PRLHP81277 87 aa6.12□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.12□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.12□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 BAGE3Q86Y29 109 aa6.12□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM238C9JI98 176 aa6.11□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.11□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM126AQ9H061 195 aa6.11□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.1□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 SFTA2Q6UW10 78 aa6.1□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 M0R378 163 aa6.09□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 LINC00158P58513 81 aa6.09□□□□□ -1.43
SFTPC-211ENST00000524318 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.09□□□□□ -1.43
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