RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.94□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.93□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 MALP21145 153 aa11.93□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.93□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 LINC00158P58513 81 aa11.92□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 Q8IZM0 81 aa11.92□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.92□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.92□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 PRR34Q9NV39 138 aa11.92□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 ESRGQ1W209 222 aa11.91□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.9□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 F8W1H4 67 aa11.9□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 PFN2P35080 140 aa11.9□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 FOXI1Q12951 378 aa11.9□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 ENHOQ6UWT2 76 aa11.9□□□□□ -0.5
TSNARE1-204ENST00000519651 GAGE12HA6NDE8 117 aa11.89□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TCL1BO95988 128 aa11.89□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CKS1BP61024 79 aa11.89□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 C2orf82Q6UX34 121 aa11.89□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 MTURNQ8N3F0 131 aa11.89□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.89□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CRPP02741 224 aa11.89□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 UBE2WQ96B02 151 aa11.89□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 MGAM2Q2M2H8 2515 aa11.88□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CFAP161Q6P656 301 aa11.87□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.87□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 WFDC2Q14508 124 aa11.87□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 KIAA0087Q14695 138 aa11.87□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.86□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.86□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TRIAP1O43715 76 aa11.86□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.85□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.84□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 PRO0461Q9UI25 63 aa11.84□□□□□ -0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 COX6CP09669 75 aa11.83□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 CXCL5P42830 114 aa11.83□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.83□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 CCL18P55774 89 aa11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 K7ERU9 68 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 SPAG11BQ08648 103 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 ETDBQ3ZM63 59 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 C6orf223Q8N319 242 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 ATXN8Q156A1 80 aa11.79□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.79□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 COX17Q14061 63 aa11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 CBY1Q9Y3M2 126 aa11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.77□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 IGKV2D-28P01615 120 aa11.77□□□□□ -0.52
TSNARE1-204ENST00000519651 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.77□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.76□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 C9JAW5 83 aa11.75□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 RNF151Q2KHN1 245 aa11.75□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 C10orf25Q5T742 122 aa11.75□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 CLEC2BQ92478 149 aa11.75□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 LINC01620Q4KN68 170 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC25A20O43772 301 aa11.73□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.73□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.72□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.72□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 DNAH9Q9NYC9 4486 aa11.72□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
TSNARE1-204ENST00000519651 LST1O00453 97 aa11.71□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.71□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.71□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 PCP4P48539 62 aa11.7□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 B9D2Q9BPU9 175 aa11.69□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 Q9HAA7 133 aa11.69□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.68□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.68□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.68□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 VPS25Q9BRG1 176 aa11.68□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 TEN1Q86WV5 123 aa11.67□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.67□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.67□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 J3QR89 54 aa11.66□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 C15orf56Q8N910 161 aa11.66□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 NDUFC2O95298 119 aa11.66□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 MUC7Q8TAX7 377 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-204ENST00000519651 SVIPQ8NHG7 77 aa11.65□□□□□ -0.55
TSNARE1-204ENST00000519651 M0QXV9 152 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-204ENST00000519651 COL7A1Q02388 2944 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-204ENST00000519651 DNHD1Q96M86 4753 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-204ENST00000519651 Q6ZRU5 148 aa11.62□□□□□ -0.55
TSNARE1-204ENST00000519651 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.62□□□□□ -0.55
TSNARE1-204ENST00000519651 CARD19Q96LW7 228 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms