RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513618.1

SPATA20-223, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 2

Gene SPATA20, Length 629 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-223	ENST00000513618	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618		F8VRH5	84 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	HERVK_113	P63121	156 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	IGIP	A6NJ69	53 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	G0S2	P27469	103 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	CXCL5	P42830	114 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	BCE1	O60756	84 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	TSPAN13	O95857	204 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	CRYGA	P11844	174 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A087X002	238 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPATA20-223	ENST00000513618	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SPATA20-223	ENST00000513618	TIMM17A	Q99595	171 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPATA20-223	ENST00000513618	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SPATA20-223	ENST00000513618	MT-ND4L	P03901	98 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC00167	Q96N53	147 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SPATA20-223	ENST00000513618	MUC2	Q02817	5179 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SPATA20-223	ENST00000513618	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SPATA20-223	ENST00000513618	TOMM6	Q96B49	74 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SPATA20-223	ENST00000513618	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	ERAS	Q7Z444	233 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	COX7B2	Q8TF08	81 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	UBE2A	P49459	152 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC01549	A6NIU2	74 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	GAGE10	A6NGK3	116 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	CTAG1A	P78358	180 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPATA20-223	ENST00000513618	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A1B0GVG6	124 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	ATP5L	O75964	103 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	RAB5B	P61020	215 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	TPRXL	Q17RH7	258 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	CST9L	Q9H4G1	147 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618		H3BRM9	83 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	SPINK8	P0C7L1	97 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	ADCYAP1	P18509	176 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	CDIP1	Q9H305	208 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	IGKV2D-28	P01615	120 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	PMVK	Q15126	192 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC01546	A6NGU7	62 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	RAB14	P61106	215 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	PFN2	P35080	140 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	PRLH	P81277	87 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM126A	Q9H061	195 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	SCO1	O75880	301 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	VPREB1	P12018	145 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	COX17	Q14061	63 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLC3	P0DOY3	106 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	FA2H	Q7L5A8	372 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	ERG28	Q9UKR5	140 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM238	C9JI98	176 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPATA20-223	ENST00000513618		M0R378	163 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	S100P	P25815	95 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	COX19	Q49B96	90 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	SFTA2	Q6UW10	78 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	NDUFA6	P56556	154 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	UQCC3	Q6UW78	93 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPATA20-223	ENST00000513618	CLLU1	Q5K131	121 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SPATA20-223	ENST00000513618	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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