RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	DIRC1	Q969H9	104 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549		E7EQL1	145 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q1T7F1	81 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOTCH2	Q04721	2471 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB131A	P59861	70 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549		A8MUN3	132 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BUA1	57 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF843	Q8N446	348 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	CELA1	Q9UNI1	258 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV2D-28	P01615	120 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	HCG22	E2RYF7	251 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	MUC7	Q8TAX7	377 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7EMT4	169 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	C6orf223	Q8N319	242 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	hDV103S1	A0JD37	113 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	ODF3B	A8MYP8	253 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITPR1	Q14643	2758 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BS24	57 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX7B	P24311	80 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	LCA10	Q71F78	164 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	ESM1	Q9NQ30	184 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	MUC4	Q99102	2169 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0R378	163 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00575	Q6W349	94 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	RELN	P78509	3460 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRRK2	Q5S007	2527 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7EQG2	157 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY6H	O94772	140 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8N9L7	120 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01560	Q8TB33	94 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	SYCN	Q0VAF6	134 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	CASC2	Q6XLA1	102 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	C3orf84	H3BNL1	204 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	B9D2	Q9BPU9	175 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00208	Q96KT6	92 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	CENPE	Q02224	2701 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX17	Q14061	63 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZRP5	223 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BUX3	64 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY6G6D	O95868	133 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM29	Q86T20	159 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00167	Q96N53	147 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	PTPN13	Q12923	2485 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPAG11B	Q08648	103 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8IZM0	81 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZTC4	211 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL24	O00175	119 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSCA	O43653	123 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZSN1	163 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		5.71	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01006	Q8NI28	216 aa		5.71	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	MDFI	Q99750	246 aa		5.71	□□□□□ -1.49
CRNKL1-205	ENST00000496549	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5

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