RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489694.5

RARB-208, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene RARB, Length 574 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-208ENST00000489694 TCTAP57738 103 aa2.69□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 MPV17L2Q567V2 206 aa2.69□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.69□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.69□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 PCP2Q8IVA1 136 aa2.69□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 CEND1Q8N111 149 aa2.69□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 FAM104AQ969W3 186 aa2.69□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 HIST1H4GQ99525 98 aa2.69□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 CHCHD5Q9BSY4 110 aa2.69□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 CUBNO60494 3623 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 A0A0J9YXV3 536 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 A0A0J9YY99 117 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 F5H768 121 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 NDUFA1O15239 70 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 APOMO95445 188 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 UBE2V1Q13404 147 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 COX17Q14061 63 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 C12orf74Q32Q52 190 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 Q6ZUT4 128 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 C11orf45Q8TAV5 145 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 PRR34Q9NV39 138 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 SPANXCQ9NY87 97 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 Q9UF83 564 aa2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 A0A096LPF7 62 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 TRAV10A0A0B4J240 114 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 TMEM262E9PQX1 116 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 G3V4G9 280 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 RBX1P62877 108 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 MIAQ16674 131 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 DEFB121Q5J5C9 76 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 Q8IZM0 81 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.67□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 A0A0B4J2C4 111 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 IGHV3-30P01768 117 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 FABP2P12104 132 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 BATFQ16520 125 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 LINC01556Q5JQF7 62 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 B9D2Q9BPU9 175 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 UPK3BQ9BT76 320 aa2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RARB-208ENST00000489694 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 K7EIL1 84 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 COX7A2LO14548 114 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 TAX1BP3O14907 124 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 CRPP02741 224 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 ANGP03950 147 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 COX6CP09669 75 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 CCL18P55774 89 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 REG3AQ06141 175 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 C6orf226Q5I0X4 101 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 CFAP161Q6P656 301 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 COX7B2Q8TF08 81 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 RMI2Q96E14 147 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 CELA1Q9UNI1 258 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 CBY1Q9Y3M2 126 aa2.65□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.64□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.64□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 A0A0J9YWU9 116 aa2.64□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 A0A1W2PPM0 123 aa2.64□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 NDUFAF8A1L188 74 aa2.64□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 F8W1H4 67 aa2.64□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 C3orf84H3BNL1 204 aa2.64□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 FXYD2P54710 66 aa2.64□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 CKS1BP61024 79 aa2.64□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 COX6A2Q02221 97 aa2.64□□□□□ -1.99
RARB-208ENST00000489694 VAMP3Q15836 100 aa2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms