RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489048.1

NEB-215, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEB, Length 2,738 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-215ENST00000489048 FLNCQ14315 2725 aa7.59□□□□□ -1.19
NEB-215ENST00000489048 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.59□□□□□ -1.19
NEB-215ENST00000489048 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.58□□□□□ -1.2
NEB-215ENST00000489048 SLPIP03973 132 aa7.58□□□□□ -1.2
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NEB-215ENST00000489048 Q8N814 137 aa7.58□□□□□ -1.2
NEB-215ENST00000489048 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.57□□□□□ -1.2
NEB-215ENST00000489048 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.57□□□□□ -1.2
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NEB-215ENST00000489048 SERP2Q8N6R1 65 aa7.57□□□□□ -1.2
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NEB-215ENST00000489048 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.57□□□□□ -1.2
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NEB-215ENST00000489048 DEFB130AP0DP74 79 aa7.53□□□□□ -1.2
NEB-215ENST00000489048 TMEM258P61165 79 aa7.53□□□□□ -1.2
NEB-215ENST00000489048 PRO0255Q9UI72 69 aa7.53□□□□□ -1.2
NEB-215ENST00000489048 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.53□□□□□ -1.2
NEB-215ENST00000489048 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
NEB-215ENST00000489048 POLQO75417 2590 aa7.53□□□□□ -1.2
NEB-215ENST00000489048 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.53□□□□□ -1.2
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NEB-215ENST00000489048 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.52□□□□□ -1.21
NEB-215ENST00000489048 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.52□□□□□ -1.21
NEB-215ENST00000489048 CHD6Q8TD26 2715 aa7.52□□□□□ -1.21
NEB-215ENST00000489048 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.52□□□□□ -1.21
NEB-215ENST00000489048 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.52□□□□□ -1.21
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NEB-215ENST00000489048 X6R8D5 127 aa7.51□□□□□ -1.21
NEB-215ENST00000489048 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.51□□□□□ -1.21
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NEB-215ENST00000489048 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.49□□□□□ -1.21
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NEB-215ENST00000489048 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.49□□□□□ -1.21
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NEB-215ENST00000489048 REG3AQ06141 175 aa7.47□□□□□ -1.21
NEB-215ENST00000489048 Q6ZQT0 140 aa7.47□□□□□ -1.21
NEB-215ENST00000489048 C6orf223Q8N319 242 aa7.47□□□□□ -1.21
NEB-215ENST00000489048 DPH3Q96FX2 82 aa7.47□□□□□ -1.21
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NEB-215ENST00000489048 BCE1O60756 84 aa7.47□□□□□ -1.21
NEB-215ENST00000489048 HILS1P60008 231 aa7.47□□□□□ -1.21
NEB-215ENST00000489048 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
NEB-215ENST00000489048 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.46□□□□□ -1.21
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NEB-215ENST00000489048 GHRHP01286 108 aa7.46□□□□□ -1.22
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NEB-215ENST00000489048 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.45□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.45□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.44□□□□□ -1.22
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NEB-215ENST00000489048 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.44□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.43□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.43□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 Q8N3U1 123 aa7.43□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.43□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 JMJD1CQ15652 2540 aa7.43□□□□□ -1.22
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