RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484404.1

ITGA4-210, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA4, Length 592 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-210ENST00000484404 HERVK_113P63121 156 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 Q8IZM0 81 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 NPSP0C0P6 89 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 ERASQ7Z444 233 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.35□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 SPINK8P0C7L1 97 aa8.35□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 FA2HQ7L5A8 372 aa8.35□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.35□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 LRP2P98164 4655 aa8.34□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 G0S2P27469 103 aa8.34□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 SEC11AP67812 179 aa8.34□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.34□□□□□ -1.07
ITGA4-210ENST00000484404 F8VRH5 84 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 H0Y9J4 135 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 COX7B2Q8TF08 81 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 DIRC1Q969H9 104 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 RHEBQ15382 184 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 PMCHL1Q16048 86 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 CST9LQ9H4G1 147 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 LINC01546A6NGU7 62 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 NDUFA6P56556 154 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 RAB5BP61020 215 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 C22orf24Q9Y442 160 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 PMVKQ15126 192 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 COX19Q49B96 90 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 RNF213Q63HN8 5207 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 A0A096LNJ9 63 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 APOC3P02656 99 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 CXCL5P42830 114 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 GAGE10A6NGK3 116 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGA4-210ENST00000484404 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 LINC01549A6NIU2 74 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 H3BRM9 83 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 SCO1O75880 301 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 HBDP02042 147 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 PFN2P35080 140 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 LPAP08519 4548 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 LINC00614P0C842 121 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 IGLC3P0DOY3 106 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 LINC00167Q96N53 147 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 C11orf86A6NJI1 115 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 NUPR1O60356 82 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 ZNF861PO60384 105 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 ATP5LO75964 103 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA4-210ENST00000484404 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 SNAPINO95295 136 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 NDUFA5Q16718 116 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 SVBPQ8N300 66 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.2□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.2□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 IGKV2D-28P01615 120 aa8.2□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 BAGE3Q86Y29 109 aa8.2□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 BCE1O60756 84 aa8.19□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 ERG28Q9UKR5 140 aa8.19□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.17□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.17□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 Q8NDZ9 215 aa8.17□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 YPEL4Q96NS1 127 aa8.17□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.17□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.17□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 A0A087X002 238 aa8.16□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 A0A0U1RRA0 63 aa8.16□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 UBE2AP49459 152 aa8.16□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 TSPAN13O95857 204 aa8.15□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 VPREB1P12018 145 aa8.15□□□□□ -1.1
ITGA4-210ENST00000484404 TMEM238C9JI98 176 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-210ENST00000484404 H0Y8G0 127 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-210ENST00000484404 PRLHP81277 87 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-210ENST00000484404 PRR4Q16378 134 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-210ENST00000484404 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-210ENST00000484404 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.13□□□□□ -1.11
ITGA4-210ENST00000484404 LINC00158P58513 81 aa8.12□□□□□ -1.11
ITGA4-210ENST00000484404 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms