RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa0.28□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP0.28□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LRRC7Q96NW7 1537 aa0.28□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SYCP2Q9BX26 1530 aa0.28□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 KDM5DQ9BY66 1539 aa0.28□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ARHGEF5Q12774 1597 aa0.28□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 MROH2BQ7Z745 1585 aa0.28□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 UGGT1Q9NYU2 1555 aa0.28□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 MAST1Q9Y2H9 1570 aa0.28□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 KIAA0556O60303 1618 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LRP6O75581 1613 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PREX2Q70Z35 1606 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ABCA6Q8N139 1617 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 MADDQ8WXG6 1647 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ALKQ9UM73 1620 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 TET3O43151 1660 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 GCC2Q8IWJ2 1684 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PREX1Q8TCU6 1659 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 RICTORQ6R327 1708 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LINC00587B1AMM8 73 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 HSD52Q0P140 79 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 FAM223AQ8IWN6 122 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 UACAQ9BZF9 1416 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CCDC141Q6ZP82 1450 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 NLRP1Q9C000 1473 aa0.27□□□□□ -2.37
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PTPRG-202ENST00000468576 TRPM2O94759 1503 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ATP7AQ04656 1500 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ARHGAP5Q13017 1502 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LMTK2Q8IWU2 1503 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 DUOX1Q9NRD9 1551 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PIK3C2BO00750 1634 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CROCC2H7BZ55 1655 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 KIF1AQ12756 1690 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF831Q5JPB2 1677 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SSPOA2VEC9 5147 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ITSN1Q15811 1721 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 QSER1Q2KHR3 1735 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 KNDC1Q76NI1 1749 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 UBR3Q6ZT12 1888 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
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PTPRG-202ENST00000468576 UBE2D2P62837 147 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ATP10BO94823 1461 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ADGRL2O95490 1459 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PZPP20742 1482 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ATP7BP35670 1465 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 C1orf167Q5SNV9 1468 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 RALGAPBQ86X10 1494 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 NWD1Q149M9 1564 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 IQGAP1P46940 1657 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
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PTPRG-202ENST00000468576 PLCH1Q4KWH8 1693 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 QRICH2Q9H0J4 1663 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 C4AP0C0L4 1744 aa0.26□□□□□ -2.37
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PTPRG-202ENST00000468576 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 UTRNP46939 3433 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF292O60281 2723 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PTPN13Q12923 2485 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 KIF20BQ96Q89 1820 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PPLO60437 1756 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 AKAP12Q02952 1782 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 RGPD1P0DJD0 1748 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 UBR1Q8IWV7 1749 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa0.25□□□□□ -2.37
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