RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418800.6

DDR1-232, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene DDR1, Length 3,588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-232ENST00000418800 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
DDR1-232ENST00000418800 KRTAP10-9P60411 292 aa8.4□□□□□ -1.06
DDR1-232ENST00000418800 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.4□□□□□ -1.06
DDR1-232ENST00000418800 IGLV1-40P01703 118 aa8.4□□□□□ -1.06
DDR1-232ENST00000418800 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
DDR1-232ENST00000418800 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.4□□□□□ -1.06
DDR1-232ENST00000418800 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.4□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 ESM1Q9NQ30 184 aa8.4□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.39□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 FAM236CP0DP71 79 aa8.39□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 PSMB8P28062 276 aa8.39□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 FHL2Q14192 279 aa8.39□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.39□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.39□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 C2orf48Q96LS8 159 aa8.39□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 UPK3BQ9BT76 320 aa8.39□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.38□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 TIMM17BO60830 172 aa8.38□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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DDR1-232ENST00000418800 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 TMEM86BQ8N661 226 aa8.37□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 OXTP01178 125 aa8.37□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.37□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 DAD1P61803 113 aa8.36□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.36□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.36□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.36□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 CCL18P55774 89 aa8.36□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 H0YGX0 51 aa8.35□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 K7EQD1 137 aa8.35□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 HTN3P15516 51 aa8.35□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 Q6JHZ5 121 aa8.35□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 FAM104AQ969W3 186 aa8.34□□□□□ -1.07
DDR1-232ENST00000418800 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 Q96MF0 132 aa8.33□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.33□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.33□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 A8MTW9 85 aa8.32□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 RMI2Q96E14 147 aa8.32□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.32□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.32□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 MAST4O15021 2626 aa8.31□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.31□□□□□ -1.08
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DDR1-232ENST00000418800 PRORYQ9H606 182 aa8.31□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 DEFB4AO15263 64 aa8.3□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.3□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.3□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 J3QLI3 93 aa8.3□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 IGKV2D-28P01615 120 aa8.3□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 TMEM89A2RUT3 159 aa8.3□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 PF4P02776 101 aa8.29□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.28□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.28□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 NDUFC2O95298 119 aa8.28□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.28□□□□□ -1.08
DDR1-232ENST00000418800 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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DDR1-232ENST00000418800 CCKP06307 115 aa8.27□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 LINC01600Q96MT4 127 aa8.27□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.27□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 NOTCH1P46531 2555 aa8.27□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.26□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.26□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.26□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 SS18Q15532 418 aa8.26□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.25□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 Q5XG85 94 aa8.25□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.25□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 GYPEP15421 78 aa8.25□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 KLK9Q2XQG4 91 aa8.25□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.24□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 ZNF702PQ9H963 129 aa8.24□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 STAB1Q9NY15 2570 aa8.24□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 SMR3AQ99954 134 aa8.23□□□□□ -1.09
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DDR1-232ENST00000418800 PRO0628Q9UI54 55 aa8.23□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.22□□□□□ -1.09
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DDR1-232ENST00000418800 VWFP04275 2813 aa8.22□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.22□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 ZNF843Q8N446 348 aa8.22□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.21□□□□□ -1.09
DDR1-232ENST00000418800 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.21□□□□□ -1.1
DDR1-232ENST00000418800 Q8N3U1 123 aa8.21□□□□□ -1.1
DDR1-232ENST00000418800 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.2□□□□□ -1.1
DDR1-232ENST00000418800 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.2□□□□□ -1.1
DDR1-232ENST00000418800 Q8N814 137 aa8.2□□□□□ -1.1
DDR1-232ENST00000418800 Q6ZQY7 126 aa8.2□□□□□ -1.1
DDR1-232ENST00000418800 HIVEP1P15822 2718 aa8.2□□□□□ -1.1
DDR1-232ENST00000418800 CR1P17927 2039 aa8.2□□□□□ -1.1
DDR1-232ENST00000418800 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.2□□□□□ -1.1
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