RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 IGF2RP11717 2491 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-201ENST00000401088 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-201ENST00000401088 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.65□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 A8MTW9 85 aa8.64□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.64□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.64□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1W2PPR1 153 aa8.64□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 C19orf84I3L1E1 186 aa8.64□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.64□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 Q6ZQY7 126 aa8.63□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF843Q8N446 348 aa8.63□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 BPY2O14599 106 aa8.62□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 BCE1O60756 84 aa8.62□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.62□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 A0A087WZ39 114 aa8.62□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.61□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 MSMBP08118 114 aa8.61□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 PDE6GP18545 87 aa8.61□□□□□ -1.03
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SZRD1-201ENST00000401088 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.61□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.61□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 Q6ZQT0 140 aa8.61□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 A0A096LPF7 62 aa8.61□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 DEFB130BP0DP73 79 aa8.6□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 DEFB130AP0DP74 79 aa8.6□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.6□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 BSNQ9UPA5 3926 aa8.6□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.6□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.6□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 ESRGQ1W209 222 aa8.59□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.59□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.59□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 COL12A1Q99715 3063 aa8.59□□□□□ -1.03
SZRD1-201ENST00000401088 M0R2N4 97 aa8.59□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.59□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 Q8N9L7 120 aa8.59□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 CCL19Q99731 98 aa8.58□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1W2PRX2 142 aa8.58□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 PRYO14603 147 aa8.57□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 CXCL6P80162 114 aa8.57□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 LINC00575Q6W349 94 aa8.57□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 C16orf95Q9H693 158 aa8.57□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.57□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 PMAIP1Q13794 54 aa8.56□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 LY6G6DO95868 133 aa8.56□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 AVPP01185 164 aa8.56□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 B4DSR2 109 aa8.55□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.55□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 IL17DQ8TAD2 202 aa8.55□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.55□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 MUC7Q8TAX7 377 aa8.55□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.54□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 Q8IZM0 81 aa8.54□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 PSPHP1O15172 72 aa8.53□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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SZRD1-201ENST00000401088 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.53□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 A0A096LNT2 108 aa8.53□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 EPM2AB3EWF7 344 aa8.53□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.53□□□□□ -1.04
SZRD1-201ENST00000401088 ACACBO00763 2458 aa8.52□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.52□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.52□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 PRR4Q16378 134 aa8.52□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.52□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 CELA1Q9UNI1 258 aa8.52□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.52□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 DIRC1Q969H9 104 aa8.52□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 LINC00167Q96N53 147 aa8.52□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 GYPEP15421 78 aa8.52□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 C6orf223Q8N319 242 aa8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 C3orf84H3BNL1 204 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 C16orf74Q96GX8 76 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 RETNQ9HD89 108 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 ZFHX3Q15911 3703 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 PLA2G2AP14555 144 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 H3BQ85 93 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 COX7BP24311 80 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 SPAG11BQ08648 103 aa8.47□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 COX17Q14061 63 aa8.47□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 POLQO75417 2590 aa8.47□□□□□ -1.05
SZRD1-201ENST00000401088 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.46□□□□□ -1.06
SZRD1-201ENST00000401088 LINC01006Q8NI28 216 aa8.46□□□□□ -1.06
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