RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 CCL18P55774 89 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 ACYP1P07311 99 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 LINC00643Q86TS7 51 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 C6orf99Q4VX62 202 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 BSNQ9UPA5 3926 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 APOC4P55056 127 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 REG3AQ06141 175 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 SCXQ7RTU7 201 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 DSCR8Q96T75 97 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A087WVE0 104 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A087WYN8 130 aa6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 A8MTW9 85 aa6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 TRACP01848 142 aa6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 TIMM17BO60830 172 aa6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 hADV29S1A0JD25 119 aa6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 BRI3O95415 125 aa6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42-202ENST00000393389 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 CXCL5P42830 114 aa6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 ENHOQ6UWT2 76 aa6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 Q8N3U1 123 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 FHL2Q14192 279 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 LITAFQ99732 161 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 ATOX1O00244 68 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 GHRHP01286 108 aa6.12□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 C20orf197Q8N268 126 aa6.12□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.12□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 KLK9Q2XQG4 91 aa6.12□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 C6orf223Q8N319 242 aa6.12□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 Q6ZQY7 126 aa6.11□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 IGLV1-51P01701 117 aa6.11□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.11□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A087WZ39 114 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 PSCAO43653 123 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 DIRC1Q969H9 104 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 UPK3BQ9BT76 320 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 USP17L23D6RBM5 183 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 LY6G6DO95868 133 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 RETNQ9HD89 108 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42-202ENST00000393389 UQCRQO14949 82 aa6.09□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.09□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.09□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 LINC00846Q9NV44 126 aa6.09□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 IGKV2D-28P01615 120 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 UBE2BP63146 152 aa6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 HILS1P60008 231 aa6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 C3orf84H3BNL1 204 aa6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 COX7BP24311 80 aa6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 LYRM9A8MSI8 78 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 SNURFQ9Y675 71 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 NREPQ16612 68 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 Q8IZM0 81 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 F8WEM9 126 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 J3KT08 172 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42-202ENST00000393389 Q6Q795 121 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms