RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381565.2

APOBEC3F-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3F, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3F-202ENST00000381565 RNF213Q63HN8 5207 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 F8WDY8 70 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 NDUFA1O15239 70 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 DPH3Q96FX2 82 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 GAGE2BQ13066 116 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 C2orf82Q6UX34 121 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC01549A6NIU2 74 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 HERVK_113P63121 156 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 LRP2P98164 4655 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 A0A1W2PNN7 141 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 PMCHL1Q16048 86 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 Q6ZRP5 223 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 CST9LQ9H4G1 147 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 OXTP01178 125 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC00614P0C842 121 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 SEC11AP67812 179 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 PMVKQ15126 192 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 Q8IZM0 81 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 C7orf33Q8WU49 177 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 HBDP02042 147 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 TNXBP22105 4242 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 FAM168BA1KXE4 195 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGLC3P0DOY3 106 aa7.16□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 PRSS2P07478 247 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 SPINK8P0C7L1 97 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 RAB5BP61020 215 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 GAGE2EQ4V326 116 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRGC2P03986 189 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC00310P59036 64 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 CKS1BP61024 79 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 COX7B2Q8TF08 81 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 COLCA2A8K830 154 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 F8VRH5 84 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 MT1HL1P0DM35 61 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 C11orf86A6NJI1 115 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 ATP5LO75964 103 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 CXCL5P42830 114 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 NDUFA6P56556 154 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 H3BRM9 83 aa7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 BAGE3Q86Y29 109 aa7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 M0QXV9 152 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 SCO1O75880 301 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 SERF1AO75920 110 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.08□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 NUPR1O60356 82 aa7.08□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 HSBP1O75506 76 aa7.08□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.07□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 C1orf137Q5JT78 98 aa7.06□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.06□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM223A0PJW6 202 aa7.05□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 ODF1Q14990 250 aa7.05□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 C22orf24Q9Y442 160 aa7.04□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIST1H2BKO60814 126 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 LEPROTL1O95214 131 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGLV7-43P04211 117 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIST1H2BJP06899 126 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIST1H2BOP23527 126 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIST1H2BBP33778 126 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms