RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 FN1P02751 2386 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 DEFB130BP0DP73 79 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 DEFB130AP0DP74 79 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 J3QKU1 62 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 PDZD2O15018 2839 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 XCL1P47992 114 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 CLPSL2Q6UWE3 100 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 OR13C6PQ8NH95 151 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 ACANP16112 2415 aa13.04□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa13.03□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 NCR3O14931 201 aa13.03□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 MTORP42345 2549 aa13.03□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 H0YGX0 51 aa13.02□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
CITED2-201ENST00000367651 C6orf226Q5I0X4 101 aa13.02□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 FAM110AQ9BQ89 295 aa13.02□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 CXCL5P42830 114 aa13.01□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 UNC79Q9P2D8 2635 aa13.01□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 LY6G6DO95868 133 aa13.01□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 A0A096LPF7 62 aa13□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 GYPEP15421 78 aa13□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 PRR3P79522 188 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 SS18Q15532 418 aa13□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 LINC00846Q9NV44 126 aa13□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa13□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 C3orf22Q8N5N4 141 aa13□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP1-1Q07627 177 aa12.99□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.98□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.98□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 Q8N3U1 123 aa12.96□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 C2orf48Q96LS8 159 aa12.96□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 C16orf95Q9H693 158 aa12.96□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 HECTD1Q9ULT8 2610 aa12.96□□□□□ -0.33
CITED2-201ENST00000367651 LINC00612Q8N6U2 182 aa12.95□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 UQCRQO14949 82 aa12.95□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 Q8IZM0 81 aa12.95□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 TMEM126AQ9H061 195 aa12.95□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.94□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 FASNP49327 2511 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 LINC00526Q96FQ7 95 aa12.94□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 A0A087WVE0 104 aa12.93□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 A0A1B0GUV1 79 aa12.92□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.92□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 X6R8D5 127 aa12.92□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 NOTCH2Q04721 2471 aa12.92□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 Q8NDZ9 215 aa12.92□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 KIAA0087Q14695 138 aa12.91□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 Q6JHZ5 121 aa12.91□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 COX7CP15954 63 aa12.91□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.9□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 CYSTM1Q9H1C7 97 aa12.9□□□□□ -0.34
CITED2-201ENST00000367651 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.89□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP10-3P60369 221 aa12.89□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 LINC00167Q96N53 147 aa12.89□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 VWFP04275 2813 aa12.88□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 LINC01561Q8N1V8 128 aa12.87□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 Q8N814 137 aa12.87□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 PRO0255Q9UI72 69 aa12.87□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 ATOX1O00244 68 aa12.87□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 DEFB4AO15263 64 aa12.87□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 SPATA3Q8NHX4 192 aa12.86□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 CCKP06307 115 aa12.85□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 LINC00482Q8N8I6 264 aa12.85□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.84□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 A0A1B0GX51 115 aa12.84□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 hADV29S1A0JD25 119 aa12.84□□□□□ -0.35
CITED2-201ENST00000367651 CRYGAP11844 174 aa12.83□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 NDUFC2O95298 119 aa12.82□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 ANGP03950 147 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 REG3AQ06141 175 aa12.81□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 C6orf99Q4VX62 202 aa12.81□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 WFDC9Q8NEX5 89 aa12.81□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 HILS1P60008 231 aa12.8□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 C10orf25Q5T742 122 aa12.8□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 C6orf223Q8N319 242 aa12.8□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12.79□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 USP17L23D6RBM5 183 aa12.79□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 COX17Q14061 63 aa12.79□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa12.79□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 SMR3AQ99954 134 aa12.79□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 DEFB135Q30KP9 77 aa12.78□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa12.77□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.77□□□□□ -0.36
CITED2-201ENST00000367651 UPK3BQ9BT76 320 aa12.77□□□□□ -0.37
CITED2-201ENST00000367651 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.76□□□□□ -0.37
CITED2-201ENST00000367651 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa12.76□□□□□ -0.37
CITED2-201ENST00000367651 SERP2Q8N6R1 65 aa12.76□□□□□ -0.37
CITED2-201ENST00000367651 HIVEP2P31629 2446 aa12.76□□□□□ -0.37
CITED2-201ENST00000367651 CELA1Q9UNI1 258 aa12.75□□□□□ -0.37
CITED2-201ENST00000367651 OTOGQ6ZRI0 2925 aa12.74□□□□□ -0.37
CITED2-201ENST00000367651 LYRM9A8MSI8 78 aa12.74□□□□□ -0.37
CITED2-201ENST00000367651 LINC00575Q6W349 94 aa12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.6 ms