RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365375.1

RNU6-728P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 728, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-728P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-728P-201ENST00000365375 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-728P-201ENST00000365375 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-728P-201ENST00000365375 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-728P-201ENST00000365375 GID8Q9NWU2 228 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-728P-201ENST00000365375 HIGD1AQ9Y241 93 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-728P-201ENST00000365375 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-728P-201ENST00000365375 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-728P-201ENST00000365375 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-728P-201ENST00000365375 TSLPQ969D9 159 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-728P-201ENST00000365375 SHROOM2Q13796 1616 aa-2.47□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-2.47□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 SCTP09683 121 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 IGLC1P0CG04 106 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 CMPK1P30085 196 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 TMEM128Q5BJH2 165 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 TRIQKQ629K1 86 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 SELENOSQ9BQE4 189 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 ATPIF1Q9UII2 106 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 MBD5Q9P267 1494 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 TMEM238C9JI98 176 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 B2MP61769 119 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 TAC4Q86UU9 113 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 MGST2Q99735 147 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 PCBD2Q9H0N5 130 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 C4AP0C0L4 1744 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 C4BP0C0L5 1744 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 ROCK1Q13464 1354 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 A0A1B0GX51 115 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 MT1HL1P0DM35 61 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 SEC11AP67812 179 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 ALKQ9UM73 1620 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAM223AQ8IWN6 122 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAIMQ9NVQ4 179 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 PBRM1Q86U86 1689 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 CEP152O94986 1710 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 CCL22O00626 93 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 HIGD1BQ9P298 99 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 SCN11AQ9UI33 1791 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 IGLC6P0CF74 106 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 PRO1933Q9H354 126 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-728P-201ENST00000365375 A0A1B0GU69 56 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 G0S2P27469 103 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 MGAQ8IWI9 3026 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 ITPR2Q14571 2701 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 ADGRL2O95490 1459 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 LINC00694P0DN24 101 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 S100GP29377 79 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 MMGT1Q8N4V1 131 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 CHMP6Q96FZ7 201 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 AIF1LQ9BQI0 150 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 ATMQ13315 3056 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 OVOS2Q6IE36 1432 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 CUX1P39880 1505 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 FGF7P21781 194 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 SNCAP37840 140 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 MORN2Q502X0 79 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 C5orf38Q86SI9 138 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 SMPXQ9UHP9 88 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-728P-201ENST00000365375 A0A1B0GV72 72 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 GNG10P50151 68 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 PHLPP1O60346 1717 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 CLIP1P30622 1438 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 CCDC153Q494R4 210 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 COPZ2Q9P299 210 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 TOP2BQ02880 1626 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 PREX1Q8TCU6 1659 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 KIF20BQ96Q89 1820 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAM223BA6NKX1 122 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-728P-201ENST00000365375 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 176.1 ms