RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362957.1

RNU6-1290P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1290, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1290P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 K7EP13 123 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PTMAP06454 111 aaKnown RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CEBPGP53567 150 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TSLPQ969D9 159 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MGST2Q99735 147 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C9orf16Q9BUW7 83 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NWD2Q9ULI1 1742 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CUX1P39880 1505 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A1B0GWA3 101 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MT-ATP8P03928 68 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DEFB130BP0DP73 79 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DEFB130AP0DP74 79 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LIN52Q52LA3 116 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C9orf153Q5TBE3 101 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SERP2Q8N6R1 65 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DYDC1Q8WWB3 177 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SS18L2Q9UHA2 77 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KDM5CP41229 1560 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SMIM24O75264 130 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C3orf79P0CE67 100 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPART-AS1P0CW21 52 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HLA-DRB4P13762 266 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ARMC1Q9NVT9 282 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CALML5Q9NZT1 146 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SMPXQ9UHP9 88 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DAPK1P53355 1430 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A2MP01023 1474 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 E7EQ34 232 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 M0R129 80 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GNGT1P63211 74 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DEFB136Q30KP8 78 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM128Q5BJH2 165 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MMGT1Q8N4V1 131 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BANF2Q9H503 90 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A0G2JND7 137 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NIPSNAP2O75323 286 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ARMS2P0C7Q2 107 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 COX7BP24311 80 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMED4Q7Z7H5 227 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPTSSAQ969W0 71 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TET3O43151 1660 aa-2.47□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ADGBQ8N7X0 1667 aa-2.47□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MT-ND4LP03901 98 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IAPPP10997 89 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MNS1Q8NEH6 495 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PBRM1Q86U86 1689 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM24BQ8N5W8 94 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCDC42Q96M95 316 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MED31Q9Y3C7 131 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IFT140Q96RY7 1462 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MAPKBP1O60336 1514 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ATG12O94817 140 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NDUFB6O95139 128 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SERPINB1P30740 379 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SFTA2Q6UW10 78 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM9CQ8IZT9 166 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRGV9Q99603 122 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SIKE1Q9BRV8 207 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ABCC5O15440 1437 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLXNC1O60486 1568 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PAEPP09466 180 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IFI6P09912 130 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DPH3Q96FX2 82 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLB1Q6P1J6 1458 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SHROOM2Q13796 1616 aa-2.52□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 188.6 ms