RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 CRPP02741 224 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 MALP21145 153 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 COPS9Q8WXC6 57 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 ERG28Q9UKR5 140 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 UBE2WQ96B02 151 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 H7C2G1 150 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 KIAA0087Q14695 138 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.42□□□□□ -1.06
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ZNF548-201ENST00000336128 CFAP161Q6P656 301 aa8.41□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.41□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.41□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 Q1RN00 199 aa8.41□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.41□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 C2orf82Q6UX34 121 aa8.41□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.4□□□□□ -1.06
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ZNF548-201ENST00000336128 CKS1BP61024 79 aa8.39□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.39□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 PFN2P35080 140 aa8.39□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 PSMB2P49721 201 aa8.39□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 H3BMG7 143 aa8.38□□□□□ -1.07
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ZNF548-201ENST00000336128 B9D2Q9BPU9 175 aa8.38□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.36□□□□□ -1.07
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ZNF548-201ENST00000336128 CCL18P55774 89 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 TRIAP1O43715 76 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 C6orf223Q8N319 242 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.34□□□□□ -1.07
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ZNF548-201ENST00000336128 MTURNQ8N3F0 131 aa8.33□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.33□□□□□ -1.08
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ZNF548-201ENST00000336128 C10orf25Q5T742 122 aa8.33□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.33□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 COX17Q14061 63 aa8.32□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.32□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.32□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 IGKV2D-28P01615 120 aa8.32□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 WFDC2Q14508 124 aa8.32□□□□□ -1.08
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ZNF548-201ENST00000336128 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 COX6CP09669 75 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 ATXN8Q156A1 80 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 C15orf56Q8N910 161 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 UPK3BQ9BT76 320 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 Q9HAA7 133 aa8.3□□□□□ -1.08
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ZNF548-201ENST00000336128 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.29□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.28□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.28□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 CLEC2BQ92478 149 aa8.27□□□□□ -1.08
ZNF548-201ENST00000336128 LINC01620Q4KN68 170 aa8.27□□□□□ -1.09
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ZNF548-201ENST00000336128 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.27□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 C9JAW5 83 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 APLNQ9ULZ1 77 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 LST1O00453 97 aa8.25□□□□□ -1.09
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ZNF548-201ENST00000336128 C2orf48Q96LS8 159 aa8.25□□□□□ -1.09
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ZNF548-201ENST00000336128 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 SLC25A20O43772 301 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 Q6ZRU5 148 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 RMI2Q96E14 147 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 K7ERU9 68 aa8.23□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 Q8NDZ9 215 aa8.23□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.23□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 F8WDY8 70 aa8.22□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 CASC10Q5T4H9 136 aa8.22□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.21□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 NCR3O14931 201 aa8.21□□□□□ -1.09
ZNF548-201ENST00000336128 M0QXV9 152 aa8.21□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 NUPR2A6NF83 97 aa8.2□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 SYCNQ0VAF6 134 aa8.2□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 USP17L23D6RBM5 183 aa8.2□□□□□ -1.1
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