RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 Q8IZM0 81 aa14.93□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.93□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 Q8N3U1 123 aa14.92□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 CLEC2BQ92478 149 aa14.92□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 LST1O00453 97 aa14.92□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 CARD19Q96LW7 228 aa14.92□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 LINC01600Q96MT4 127 aa14.9□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa14.9□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa14.9□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 GAGE12HA6NDE8 117 aa14.9□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 COX7A2LO14548 114 aa14.9□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 PFN2P35080 140 aa14.9□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 RETNQ9HD89 108 aa14.9□□□□□ -0.02
SPHK1-201ENST00000323374 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa14.88□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 SPATA25Q9BR10 227 aa14.88□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 CCL18P55774 89 aa14.87□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 CRPP02741 224 aa14.87□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 MALP21145 153 aa14.86□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 CKS1BP61024 79 aa14.86□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 C2orf82Q6UX34 121 aa14.85□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa14.84□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 H3BT86 120 aa14.84□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 IGKV2D-28P01615 120 aa14.84□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 LYPD5Q6UWN5 251 aa14.84□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 CFAP161Q6P656 301 aa14.84□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 LINC00337Q8N6G1 96 aa14.84□□□□□ -0.03
SPHK1-201ENST00000323374 CXCL5P42830 114 aa14.83□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 KIAA0087Q14695 138 aa14.83□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 H3BNG1 76 aa14.83□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 SIGMAR1Q99720 223 aa14.83□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 PRR34Q9NV39 138 aa14.81□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 RPL28P46779 137 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 KLK12Q9UKR0 248 aa14.8□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 Q6ZTC4 211 aa14.79□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 COX17Q14061 63 aa14.78□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 UBE2WQ96B02 151 aa14.77□□□□□ -0.04
SPHK1-201ENST00000323374 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.77□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.77□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 CDIP1Q9H305 208 aa14.76□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 TRACP01848 142 aa14.75□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 ENHOQ6UWT2 76 aa14.75□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 A0A0J9YWU9 116 aa14.74□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 SMIM11BQ8TCY0 68 aa14.74□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 SPAG11BQ08648 103 aa14.72□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 ANK2Q01484 3957 aa14.72□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.72□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.72□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa14.71□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 STAB1Q9NY15 2570 aa14.71□□□□□ -0.05
SPHK1-201ENST00000323374 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.71□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 C11orf45Q8TAV5 145 aa14.69□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 SCGB1A1P11684 91 aa14.69□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 H0YGX0 51 aa14.68□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 NDUFC2O95298 119 aa14.68□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 C6orf223Q8N319 242 aa14.68□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.67□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa14.66□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.66□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.66□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 ESRGQ1W209 222 aa14.66□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.65□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 C10orf25Q5T742 122 aa14.65□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 MUC7Q8TAX7 377 aa14.65□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 BAALC-AS2P0C853 105 aa14.65□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.65□□□□□ -0.06
SPHK1-201ENST00000323374 LINC00526Q96FQ7 95 aa14.64□□□□□ -0.07
SPHK1-201ENST00000323374 XGP55808 180 aa14.63□□□□□ -0.07
SPHK1-201ENST00000323374 PRR3P79522 188 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPHK1-201ENST00000323374 Q9HAA7 133 aa14.62□□□□□ -0.07
SPHK1-201ENST00000323374 MAST4O15021 2626 aa14.62□□□□□ -0.07
SPHK1-201ENST00000323374 A0A087WYN8 130 aa14.61□□□□□ -0.07
SPHK1-201ENST00000323374 DNAL4O96015 105 aa14.61□□□□□ -0.07
SPHK1-201ENST00000323374 MT-ATP8P03928 68 aa14.6□□□□□ -0.07
SPHK1-201ENST00000323374 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM126AQ9H061 195 aa14.59□□□□□ -0.07
SPHK1-201ENST00000323374 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 LINC01556Q5JQF7 62 aa14.57□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa14.57□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 C22orf24Q9Y442 160 aa14.56□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa14.55□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa14.55□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 LECT2O14960 151 aa14.55□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 C6orf48Q9UBA6 75 aa14.55□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 TENM3Q9P273 2699 aa14.55□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 NCR3O14931 201 aa14.54□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 Q8NDZ9 215 aa14.54□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.54□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.53□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.53□□□□□ -0.08
SPHK1-201ENST00000323374 K7EIL1 84 aa14.52□□□□□ -0.09
SPHK1-201ENST00000323374 HIGD2BQ4VC39 106 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms