RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa11.42□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.41□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.41□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 NUPR2A6NF83 97 aa11.41□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 ZNF702PQ9H963 129 aa11.4□□□□□ -0.58
CTIF-201ENST00000256413 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.4□□□□□ -0.59
CTIF-201ENST00000256413 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-201ENST00000256413 Q9UF83 564 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-201ENST00000256413 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CTIF-201ENST00000256413 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CTIF-201ENST00000256413 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CTIF-201ENST00000256413 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-201ENST00000256413 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-201ENST00000256413 A0A087WSZ3 146 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-201ENST00000256413 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.37□□□□□ -0.59
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CTIF-201ENST00000256413 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.37□□□□□ -0.59
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CTIF-201ENST00000256413 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
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CTIF-201ENST00000256413 C6orf223Q8N319 242 aa11.33□□□□□ -0.59
CTIF-201ENST00000256413 C19orf84I3L1E1 186 aa11.33□□□□□ -0.6
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CTIF-201ENST00000256413 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa11.33□□□□□ -0.6
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CTIF-201ENST00000256413 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.32□□□□□ -0.6
CTIF-201ENST00000256413 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa11.32□□□□□ -0.6
CTIF-201ENST00000256413 F8WDY8 70 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-201ENST00000256413 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-201ENST00000256413 SPAG11AQ6PDA7 123 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-201ENST00000256413 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CTIF-201ENST00000256413 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-201ENST00000256413 BRI3O95415 125 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-201ENST00000256413 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-201ENST00000256413 Q9BRP9 147 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-201ENST00000256413 CEP192Q8TEP8 1941 aa11.27□□□□□ -0.6
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 CD164Q04900 197 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 PTPN13Q12923 2485 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 LITAFQ99732 161 aa11.26□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 DSCAMO60469 2012 aa11.26□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 LTBP2Q14767 1821 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 KIAA0087Q14695 138 aa11.24□□□□□ -0.61
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CTIF-201ENST00000256413 A0A1B0GU69 56 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 ERC2-IT1O76042 136 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 A0A1B0GW54 56 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 C2orf48Q96LS8 159 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 C8orf87E5RJ46 101 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 H3BPC8 53 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 A8MUN3 132 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 C10orf142B7Z368 130 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-201ENST00000256413 PTPRSQ13332 1948 aa11.21□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 KLKP1Q107X0 134 aa11.21□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 HIVEP2P31629 2446 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 WIPF1O43516 503 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 SPINK1P00995 79 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 LRP4O75096 1905 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZTC4 211 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZRU5 148 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 M0R2N4 97 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 ADAMTS20P59510 1910 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 RETNLBQ9BQ08 111 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 H7BZZ5 65 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-201ENST00000256413 AVPP01185 164 aa11.15□□□□□ -0.62
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CTIF-201ENST00000256413 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CTIF-201ENST00000256413 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa11.13□□□□□ -0.63
CTIF-201ENST00000256413 IGLV1-51P01701 117 aa11.12□□□□□ -0.63
CTIF-201ENST00000256413 Q8NBF4 154 aa11.12□□□□□ -0.63
CTIF-201ENST00000256413 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.1□□□□□ -0.63
CTIF-201ENST00000256413 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-201ENST00000256413 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-201ENST00000256413 PRLHP81277 87 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-201ENST00000256413 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-201ENST00000256413 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-201ENST00000256413 C22orf24Q9Y442 160 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-201ENST00000256413 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-201ENST00000256413 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CTIF-201ENST00000256413 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.06□□□□□ -0.64
CTIF-201ENST00000256413 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.06□□□□□ -0.64
CTIF-201ENST00000256413 PTPRBP23467 1997 aa11.06□□□□□ -0.64
CTIF-201ENST00000256413 X6R8D5 127 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-201ENST00000256413 MYO9AB2RTY4 2548 aa11.04□□□□□ -0.64
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