RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SLPIP03973 132 aa8.61□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q6ZQY7 126 aa8.61□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRIAP1O43715 76 aa8.61□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BPY2O14599 106 aa8.6□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 AMELXQ99217 191 aa8.6□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 F8WDY8 70 aa8.59□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.59□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.59□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KLK9Q2XQG4 91 aa8.59□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MDFIQ99750 246 aa8.59□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 X6R8D5 127 aa8.59□□□□□ -1.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 COX6A2Q02221 97 aa8.58□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.58□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C2orf48Q96LS8 159 aa8.58□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MT-ATP8P03928 68 aa8.57□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MUC4Q99102 2169 aa8.57□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.56□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SVIPQ8NHG7 77 aa8.56□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.56□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CCKP06307 115 aa8.56□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.56□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C5orf42Q9H799 3197 aa8.56□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 H3BNG1 76 aa8.55□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00310P59036 64 aa8.55□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ESRGQ1W209 222 aa8.55□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.54□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 J3KT08 172 aa8.53□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.53□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.52□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00643Q86TS7 51 aa8.52□□□□□ -1.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.52□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRANK1O15050 2925 aa8.52□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.52□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ATOX1O00244 68 aa8.52□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q8NAQ8 132 aa8.52□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 UPK3BQ9BT76 320 aa8.52□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.52□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.52□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LAMA3Q16787 3333 aa8.51□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00315P59091 139 aa8.51□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 REG3GQ6UW15 175 aa8.51□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.51□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A096LNJ9 63 aa8.51□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.51□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.5□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LST1O00453 97 aa8.5□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q6ZRU5 148 aa8.5□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.49□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.49□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C3orf84H3BNL1 204 aa8.49□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGKV4-1P06312 121 aa8.49□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.49□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.48□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.48□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C1orf137Q5JT78 98 aa8.48□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A0C4DFX4 3053 aa8.48□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BPTFQ12830 3046 aa8.47□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.46□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NDUFC2O95298 119 aa8.46□□□□□ -1.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C10orf25Q5T742 122 aa8.46□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SCXQ7RTU7 201 aa8.46□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.45□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 K7EIL1 84 aa8.45□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.45□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.44□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.44□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C5orf47Q569G3 176 aa8.44□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRYO14603 147 aa8.43□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 XGP55808 180 aa8.43□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q9UF83 564 aa8.42□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.42□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.41□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.41□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP10-11P60412 298 aa8.41□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP10-3P60369 221 aa8.41□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q8N814 137 aa8.41□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.4□□□□□ -1.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CCDC179H3BU77 68 aa8.4□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C22orf24Q9Y442 160 aa8.4□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ENHOQ6UWT2 76 aa8.39□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.39□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM258P61165 79 aa8.39□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A8MTW9 85 aa8.39□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q6JHZ5 121 aa8.39□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MGAQ8IWI9 3026 aa8.38□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.38□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 UQCRQO14949 82 aa8.38□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 STAB1Q9NY15 2570 aa8.37□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CASC2Q6XLA1 102 aa8.37□□□□□ -1.07
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