RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.32□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 LCE6AA0A183 80 aa7.32□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 A4D1N5 150 aa7.32□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.32□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 CXCL5P42830 114 aa7.32□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.32□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 Q8IZM0 81 aa7.32□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 SPATA25Q9BR10 227 aa7.32□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 Q9H8V8 135 aa7.32□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 DEFB4AO15263 64 aa7.31□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 COX17Q14061 63 aa7.31□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 PRR34Q9NV39 138 aa7.31□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.31□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 DNAH2Q9P225 4427 aa7.31□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.3□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 APOMO95445 188 aa7.3□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 IGHV3-33P01772 117 aa7.3□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 COX6CP09669 75 aa7.3□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.3□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.3□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.3□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.29□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 REG3AQ06141 175 aa7.29□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.29□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.29□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.29□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 A0A0J9YWU9 116 aa7.28□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 F8WDY8 70 aa7.28□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 K7ERJ3 54 aa7.28□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 COX7A2LO14548 114 aa7.28□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 TSPAN13O95857 204 aa7.28□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.28□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.28□□□□□ -1.24
CDCA3-201ENST00000229265 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.27□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 M0QXV9 152 aa7.27□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 LINC01600Q96MT4 127 aa7.27□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.26□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.26□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.26□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.26□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 K7ERU9 68 aa7.25□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 HTN3P15516 51 aa7.25□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 C5orf38Q86SI9 138 aa7.25□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 HERC2O95714 4834 aa7.25□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 XCL1P47992 114 aa7.24□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 CKS1BP61024 79 aa7.24□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 Q6ZTC4 211 aa7.24□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.23□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 MALP21145 153 aa7.23□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 PSMB2P49721 201 aa7.23□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 KIAA0087Q14695 138 aa7.23□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.23□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 CFAP161Q6P656 301 aa7.23□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.23□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 H3BMG7 143 aa7.22□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 J3QR89 54 aa7.22□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 NDUFC2O95298 119 aa7.22□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 LINC00158P58513 81 aa7.22□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 FOXI1Q12951 378 aa7.22□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 ENHOQ6UWT2 76 aa7.22□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.22□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.22□□□□□ -1.25
CDCA3-201ENST00000229265 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 CRPP02741 224 aa7.21□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 ATXN8Q156A1 80 aa7.21□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 ESRGQ1W209 222 aa7.21□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.21□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 Q1RN00 199 aa7.2□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.2□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 PRO0461Q9UI25 63 aa7.2□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 KLK12Q9UKR0 248 aa7.2□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.19□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 H0YGX0 51 aa7.19□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.19□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.19□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.19□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 PKD1P98161 4303 aa7.18□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 PKHD1P08F94 4074 aa7.18□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.18□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 TCL1BO95988 128 aa7.18□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 CCL18P55774 89 aa7.18□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 C2orf48Q96LS8 159 aa7.18□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.17□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 CARD19Q96LW7 228 aa7.17□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 UPK3BQ9BT76 320 aa7.17□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 TRIAP1O43715 76 aa7.16□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 WFDC2Q14508 124 aa7.16□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 DAND5Q8N907 189 aa7.16□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 UBE2WQ96B02 151 aa7.16□□□□□ -1.26
CDCA3-201ENST00000229265 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.6 ms