RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-201ENST00000155840 CYSTM1Q9H1C7 97 aa12.15□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 CXCL5P42830 114 aa12.14□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 LINC00643Q86TS7 51 aa12.14□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa12.14□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 F8P00451 2351 aa12.14□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 HILS1P60008 231 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 SMR3AQ99954 134 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 TRACP01848 142 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 PLAC8L1A1L4L8 177 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 CFAP161Q6P656 301 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF152Q8N8N0 203 aa12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A1B0GX51 115 aa12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa12.11□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa12.11□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa12.11□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 FHL2Q14192 279 aa12.11□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 COPS9Q8WXC6 57 aa12.11□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 DEFB121Q5J5C9 76 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 FSHBP01225 129 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 LINC01006Q8NI28 216 aa12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 RPL28P46779 137 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 SPATA3Q8NHX4 192 aa12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-201ENST00000155840 ANGP03950 147 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 INAFM2P0DMQ5 153 aa12.08□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 C6orf223Q8N319 242 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 C16orf74Q96GX8 76 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ACYP1P07311 99 aa12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 DEFB135Q30KP9 77 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SVIPQ8NHG7 77 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 IL17DQ8TAD2 202 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 PF4P02776 101 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.02□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SS18Q15532 418 aa12.02□□□□□ -0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A087WZ39 114 aa12.02□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 C6orf99Q4VX62 202 aa12.02□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM86BQ8N661 226 aa12.02□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM222AQ5U5X8 452 aa12.01□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 LINC01600Q96MT4 127 aa12.01□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.01□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 OTOGQ6ZRI0 2925 aa12.01□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 S100A7L2Q5SY68 101 aa12.01□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 ENHOQ6UWT2 76 aa12.01□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 Q8NDZ9 215 aa12.01□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 DSCR8Q96T75 97 aa12.01□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 XAGE1AQ9HD64 81 aa12□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.99□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 C10orf25Q5T742 122 aa11.99□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 SCXQ7RTU7 201 aa11.99□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 UQCRQO14949 82 aa11.99□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.99□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF843Q8N446 348 aa11.98□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.98□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.98□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 M0R2N4 97 aa11.98□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.98□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM110AQ9BQ89 295 aa11.98□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.97□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 LINC01561Q8N1V8 128 aa11.97□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 COX7CP15954 63 aa11.97□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.96□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 USP17L23D6RBM5 183 aa11.96□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 H0YGX0 51 aa11.96□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 BAHCC1Q9P281 2608 aa11.96□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 HAMPP81172 84 aa11.96□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM126AQ9H061 195 aa11.96□□□□□ -0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 IGLV1-51P01701 117 aa11.96□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 IMUPQ9GZP8 106 aa11.94□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 KLK12Q9UKR0 248 aa11.94□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.93□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 NOTCH1P46531 2555 aa11.93□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 REG3AQ06141 175 aa11.92□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 C2orf48Q96LS8 159 aa11.92□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 Q8N814 137 aa11.91□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 GHRHP01286 108 aa11.9□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 ATOX1O00244 68 aa11.9□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.9□□□□□ -0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CELA1Q9UNI1 258 aa11.9□□□□□ -0.51
KCNQ1-201ENST00000155840 C20orf197Q8N268 126 aa11.89□□□□□ -0.51
KCNQ1-201ENST00000155840 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.89□□□□□ -0.51
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
KCNQ1-201ENST00000155840 PRO0255Q9UI72 69 aa11.89□□□□□ -0.51
KCNQ1-201ENST00000155840 MAST4O15021 2626 aa11.88□□□□□ -0.51
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP10-3P60369 221 aa11.88□□□□□ -0.51
KCNQ1-201ENST00000155840 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
KCNQ1-201ENST00000155840 DAD1P61803 113 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms