RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 CITED1Q99966 193 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV1-51P01701 117 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 CKS1BP61024 79 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 CRLF1O75462 422 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 C2orf82Q6UX34 121 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 C16orf74Q96GX8 76 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 C16orf95Q9H693 158 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2WQ96B02 151 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 MTORP42345 2549 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GV72 72 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM243Q9BU79 118 aa9.4□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 ITPR2Q14571 2701 aa9.4□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.39□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.39□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 H3BT86 120 aa9.39□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.39□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.39□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.39□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM262E9PQX1 116 aa9.39□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.38□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 COX6CP09669 75 aa9.38□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 FHL2Q14192 279 aa9.38□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.37□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 CIDEAO60543 219 aa9.37□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE6Q13070 117 aa9.37□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2L6O14933 153 aa9.36□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP10-3P60369 221 aa9.36□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.36□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 TEX29Q8N6K0 151 aa9.36□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.36□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 COX7A2LO14548 114 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 C22orf24Q9Y442 160 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 HERV-K104P63124 156 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 VWFP04275 2813 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV2D-28P01615 120 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 COX7B2Q8TF08 81 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 HILS1P60008 231 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 TTC32Q5I0X7 151 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 SMR3AQ99954 134 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 SNCGO76070 127 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB130BP0DP73 79 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB130AP0DP74 79 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 COPS9Q8WXC6 57 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087WZ39 114 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 X6R8D5 127 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 C5orf38Q86SI9 138 aa9.27□□□□□ -0.92
C9orf170-201ENST00000623052 TRACP01848 142 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 CCL18P55774 89 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE2BQ13066 116 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE2EQ4V326 116 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 Q6Q795 121 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 GYPEP15421 78 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 Q9HAA7 133 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087WYN8 130 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 CRPP02741 224 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00158P58513 81 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 A0A096LPF7 62 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms