RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPANXCQ9NY87 97 aa8.34□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2L6O14933 153 aa8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CIDEAO60543 219 aa8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LY6G6DO95868 133 aa8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CARD19Q96LW7 228 aa8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE6Q13070 117 aa8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM243Q9BU79 118 aa8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFA1O15239 70 aa8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FHL2Q14192 279 aa8.32□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.32□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRLF1O75462 422 aa8.32□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.31□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A20O43772 301 aa8.31□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEN1Q86WV5 123 aa8.31□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.31□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.31□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 F5H768 121 aa8.31□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.31□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIGMAR1Q99720 223 aa8.31□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.3□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INAFM1C9JVW0 142 aa8.3□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLEC2BQ92478 149 aa8.3□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.3□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.29□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.29□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.29□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA25Q9BR10 227 aa8.29□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.29□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB4AO15263 64 aa8.29□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.29□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.29□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A096LPF7 62 aa8.28□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.28□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.28□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIMM17BO60830 172 aa8.28□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01620Q4KN68 170 aa8.28□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.28□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.28□□□□□ -1.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATXN8Q156A1 80 aa8.27□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDIP1Q9H305 208 aa8.27□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFITM1P13164 125 aa8.26□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GYPEP15421 78 aa8.26□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 X6R8D5 127 aa8.26□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.25□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C5orf38Q86SI9 138 aa8.25□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM262E9PQX1 116 aa8.24□□□□□ -1.09
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB135Q30KP9 77 aa8.24□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.24□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF183Q96D59 192 aa8.23□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 F8P00451 2351 aa8.23□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H7C423 109 aa8.23□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.23□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.23□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MT-ATP8P03928 68 aa8.23□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.23□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.22□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 XGP55808 180 aa8.22□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COX7B2Q8TF08 81 aa8.22□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.22□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C2orf82Q6UX34 121 aa8.22□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.21□□□□□ -1.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STAB1Q9NY15 2570 aa8.21□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 XCL1P47992 114 aa8.21□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LST1O00453 97 aa8.2□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8N3U1 123 aa8.2□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.2□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.2□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HERV-K104P63124 156 aa8.2□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PFN2P35080 140 aa8.19□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00158P58513 81 aa8.19□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRO0255Q9UI72 69 aa8.19□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.19□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.19□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAX4O43316 350 aa8.18□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A087WZ39 114 aa8.18□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 M0QXV9 152 aa8.17□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.17□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.17□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.16□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2WQ96B02 151 aa8.16□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CELA1Q9UNI1 258 aa8.16□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.16□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.16□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.16□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.16□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV2D-28P01615 120 aa8.16□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.16□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COPS9Q8WXC6 57 aa8.16□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COX7A2LO14548 114 aa8.15□□□□□ -1.1
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