RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556496.2

NRXN3-213, Transcript of neurexin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NRXN3, Length 2,737 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3-213ENST00000556496 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 TIMM17BO60830 172 aa7.45□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.45□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.45□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE6Q13070 117 aa7.45□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.44□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 A0A0U1RRA0 63 aa7.44□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 F5H768 121 aa7.44□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 H7C423 109 aa7.44□□□□□ -1.22
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NRXN3-213ENST00000556496 TRIAP1O43715 76 aa7.43□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 FOXI1Q12951 378 aa7.43□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.43□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.43□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.43□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 VWFP04275 2813 aa7.43□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 RNF183Q96D59 192 aa7.43□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.42□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.42□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 C9JAW5 83 aa7.42□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 X6R8D5 127 aa7.42□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.42□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.42□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.42□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.42□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 TEN1Q86WV5 123 aa7.42□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.41□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.41□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.41□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 SLC25A20O43772 301 aa7.41□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 GYPEP15421 78 aa7.41□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 ATXN8Q156A1 80 aa7.41□□□□□ -1.22
NRXN3-213ENST00000556496 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.4□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.39□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.39□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 COX6CP09669 75 aa7.39□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 HERV-K104P63124 156 aa7.39□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 DEFB135Q30KP9 77 aa7.39□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 LINC01620Q4KN68 170 aa7.39□□□□□ -1.23
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NRXN3-213ENST00000556496 CARD19Q96LW7 228 aa7.39□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.38□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 SPATA25Q9BR10 227 aa7.38□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.38□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 DEFB4AO15263 64 aa7.38□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 SIGMAR1Q99720 223 aa7.38□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 PRO0255Q9UI72 69 aa7.38□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.38□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 A0A096LPF7 62 aa7.37□□□□□ -1.23
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NRXN3-213ENST00000556496 HIVEP1P15822 2718 aa7.37□□□□□ -1.23
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NRXN3-213ENST00000556496 CITED1Q99966 193 aa7.36□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 LYRM9A8MSI8 78 aa7.36□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 M0QXV9 152 aa7.36□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 PAX4O43316 350 aa7.36□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 APOC4P55056 127 aa7.36□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.35□□□□□ -1.23
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NRXN3-213ENST00000556496 A0A087WZ39 114 aa7.35□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.34□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 LST1O00453 97 aa7.34□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 XCL1P47992 114 aa7.34□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 CDIP1Q9H305 208 aa7.34□□□□□ -1.23
NRXN3-213ENST00000556496 A0A1B0GUV1 79 aa7.33□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.33□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.33□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 DAD1P61803 113 aa7.33□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 C2orf82Q6UX34 121 aa7.33□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00158P58513 81 aa7.32□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 SS18Q15532 418 aa7.32□□□□□ -1.24
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NRXN3-213ENST00000556496 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.31□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.31□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 LINC01600Q96MT4 127 aa7.31□□□□□ -1.24
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NRXN3-213ENST00000556496 Q8NAQ8 132 aa7.31□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.31□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 CELA1Q9UNI1 258 aa7.31□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.3□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 PFN2P35080 140 aa7.3□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.3□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.3□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 H3BT86 120 aa7.3□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 COX7A2LO14548 114 aa7.3□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 MIFP14174 115 aa7.3□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.3□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.29□□□□□ -1.24
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